289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12383 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12383  Apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
527 aa  1075    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0630157  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  49.8 
 
 
532 aa  526  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  42.26 
 
 
533 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6937  apolipoprotein N-acyltransferase  38.91 
 
 
538 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.207739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0412  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 
539 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.107185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 
560 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  28.54 
 
 
545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  28.55 
 
 
537 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  27.56 
 
 
519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  26.38 
 
 
554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  28.24 
 
 
537 aa  181  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  26.7 
 
 
526 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  26.18 
 
 
487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  25.82 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  26.35 
 
 
553 aa  130  9.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  24.86 
 
 
525 aa  127  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
507 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  27.34 
 
 
507 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  25.48 
 
 
521 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  28.08 
 
 
514 aa  124  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  25.87 
 
 
542 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  27.56 
 
 
510 aa  123  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  23.23 
 
 
521 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  24.31 
 
 
550 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1507  apolipoprotein N-acyltransferase  22.63 
 
 
501 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  24.58 
 
 
506 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  25.73 
 
 
516 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  25.23 
 
 
513 aa  107  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0986  apolipoprotein N-acyltransferase  21.9 
 
 
760 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  25.22 
 
 
537 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1882  apolipoprotein N-acyltransferase  24.58 
 
 
488 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  25.58 
 
 
529 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  24.14 
 
 
491 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  25.61 
 
 
526 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  27.76 
 
 
505 aa  99.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0666  apolipoprotein N-acyltransferase  25.52 
 
 
491 aa  99.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  25.48 
 
 
523 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  24.94 
 
 
557 aa  97.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  25.74 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  23.35 
 
 
475 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  24.59 
 
 
528 aa  94  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  24.85 
 
 
510 aa  94  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  25.27 
 
 
522 aa  94  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  22.5 
 
 
530 aa  93.6  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  28.04 
 
 
528 aa  93.6  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  32.34 
 
 
534 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  30.5 
 
 
534 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  23.7 
 
 
544 aa  91.7  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  25.5 
 
 
520 aa  91.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  23.53 
 
 
525 aa  91.3  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
515 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
515 aa  91.3  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
515 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  31.78 
 
 
535 aa  90.9  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  24.51 
 
 
521 aa  90.9  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
479 aa  90.1  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  23.53 
 
 
524 aa  88.2  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  28.79 
 
 
536 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  23.89 
 
 
489 aa  88.2  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  35.67 
 
 
543 aa  87.8  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  24.04 
 
 
504 aa  87  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  30.85 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  23.28 
 
 
532 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  31.25 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  24.4 
 
 
502 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  27.08 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1141  apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0258943  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  23.3 
 
 
511 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  28.75 
 
 
518 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  25.89 
 
 
509 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  25.18 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  25.18 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  29.21 
 
 
498 aa  84.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208778  decreased coverage  0.000201014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 
518 aa  84  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  25.42 
 
 
511 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  25.05 
 
 
524 aa  84  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  28.8 
 
 
512 aa  84  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  27.18 
 
 
509 aa  84  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09030  apolipoprotein N-acyltransferase  25.89 
 
 
516 aa  83.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  23.57 
 
 
536 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  25.59 
 
 
529 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  28.12 
 
 
524 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  30.28 
 
 
487 aa  83.2  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  25.35 
 
 
500 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  29.38 
 
 
516 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  35.48 
 
 
525 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  25.39 
 
 
576 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  25.25 
 
 
529 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  28.75 
 
 
524 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  25.25 
 
 
529 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  25.25 
 
 
529 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  31.65 
 
 
511 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  23.91 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  28.75 
 
 
524 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  26.1 
 
 
524 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  32.28 
 
 
507 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  23.05 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  32.9 
 
 
472 aa  82  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  29.61 
 
 
511 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>