297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6937 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6937  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
538 aa  1106    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.207739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12383  Apolipoprotein N-acyltransferase  39.02 
 
 
527 aa  352  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0630157  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  38.68 
 
 
533 aa  347  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  35.74 
 
 
532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0412  apolipoprotein N-acyltransferase  34.77 
 
 
539 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.107185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 
526 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  29.73 
 
 
560 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
554 aa  221  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 
545 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  29.6 
 
 
537 aa  216  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  28.38 
 
 
519 aa  203  6e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 
537 aa  191  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 
525 aa  153  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  28.16 
 
 
507 aa  147  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
516 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  27.08 
 
 
521 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  27.45 
 
 
507 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  29.53 
 
 
510 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  31.83 
 
 
505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1507  apolipoprotein N-acyltransferase  28.04 
 
 
501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.83 
 
 
566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  26.97 
 
 
542 aa  128  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  31.76 
 
 
513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  25.63 
 
 
506 aa  127  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  26.15 
 
 
521 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  29.13 
 
 
576 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  29.94 
 
 
512 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  32.14 
 
 
567 aa  124  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  27.3 
 
 
528 aa  123  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  27.76 
 
 
522 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  27.6 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  29.87 
 
 
526 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 
553 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 
567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  31.21 
 
 
507 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  25.88 
 
 
475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  28.99 
 
 
534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
529 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
529 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
529 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
529 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  30.74 
 
 
509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  24.68 
 
 
553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
529 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 
511 aa  115  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1364  apolipoprotein N-acyltransferase  27.99 
 
 
488 aa  114  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00243577  hitchhiker  0.000524625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.65 
 
 
506 aa  113  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  30.58 
 
 
511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09030  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 
516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  25.68 
 
 
529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  28.83 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  26.15 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  30.07 
 
 
509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  29.97 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  30.36 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  26.99 
 
 
477 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  28.47 
 
 
518 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  27.91 
 
 
535 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  29.87 
 
 
503 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  29.02 
 
 
506 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  30.24 
 
 
511 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  29.35 
 
 
536 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  30.36 
 
 
497 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.52 
 
 
503 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  29.43 
 
 
536 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  29.94 
 
 
536 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  30.48 
 
 
528 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 
541 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  24.94 
 
 
520 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0477  apolipoprotein N-acyltransferase  28.48 
 
 
488 aa  108  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  30.61 
 
 
525 aa  108  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  27.46 
 
 
518 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  27.69 
 
 
541 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
512 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
512 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
512 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  26.67 
 
 
506 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  29.97 
 
 
510 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  29.25 
 
 
506 aa  107  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
512 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
512 aa  107  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  28.01 
 
 
508 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  27.54 
 
 
509 aa  107  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  28.44 
 
 
536 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
512 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  27.69 
 
 
505 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.97 
 
 
537 aa  106  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
512 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  28.85 
 
 
502 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  26.78 
 
 
519 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  26.78 
 
 
516 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  27.3 
 
 
505 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  26.91 
 
 
543 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 
543 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  29.11 
 
 
505 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  28.29 
 
 
500 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  27.71 
 
 
512 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  26.44 
 
 
516 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  25.76 
 
 
524 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  26.1 
 
 
524 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>