290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0412 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0412  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
539 aa  1095    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.107185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  38.88 
 
 
533 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6937  apolipoprotein N-acyltransferase  35.61 
 
 
538 aa  319  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.207739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12383  Apolipoprotein N-acyltransferase  33.89 
 
 
527 aa  315  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0630157  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  34.56 
 
 
532 aa  303  6.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  29.72 
 
 
560 aa  217  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  29.89 
 
 
545 aa  216  7e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  28.12 
 
 
526 aa  207  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  29.67 
 
 
537 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  28.7 
 
 
537 aa  205  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  28.65 
 
 
554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  27.2 
 
 
519 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  28.65 
 
 
514 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  26.97 
 
 
525 aa  144  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  29.21 
 
 
553 aa  140  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  34.09 
 
 
537 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  28.52 
 
 
507 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  28.27 
 
 
507 aa  134  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  26.4 
 
 
506 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  26.67 
 
 
521 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  28.75 
 
 
536 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  25.88 
 
 
521 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  26.7 
 
 
526 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  26.52 
 
 
523 aa  124  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  26.98 
 
 
513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  27.79 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  28.66 
 
 
535 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  25.79 
 
 
521 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1921  apolipoprotein N-acyltransferase  25.49 
 
 
629 aa  120  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0008443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  25.49 
 
 
475 aa  120  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
506 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  27.54 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  27.36 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  26.58 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.16 
 
 
524 aa  118  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  27.12 
 
 
534 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  25.42 
 
 
516 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  25.56 
 
 
487 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  27.31 
 
 
489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1507  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  26.94 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  28.06 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  27.25 
 
 
541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  27.88 
 
 
510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  28.85 
 
 
512 aa  114  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  27.27 
 
 
492 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  29.79 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  24.81 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  27.98 
 
 
536 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  27.61 
 
 
550 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2579  apolipoprotein N-acyltransferase  27.1 
 
 
511 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.170018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 
536 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  29.13 
 
 
543 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  27.76 
 
 
536 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  27.64 
 
 
511 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  28.08 
 
 
509 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  25.65 
 
 
507 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  25.3 
 
 
529 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 
511 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  28.26 
 
 
553 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  25.21 
 
 
479 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0986  apolipoprotein N-acyltransferase  23.06 
 
 
760 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0666  apolipoprotein N-acyltransferase  26.11 
 
 
491 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  27.05 
 
 
506 aa  107  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  26.61 
 
 
520 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  26.68 
 
 
507 aa  107  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
512 aa  106  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
512 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  28.53 
 
 
515 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  28.53 
 
 
515 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
505 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  28.53 
 
 
515 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  26.79 
 
 
500 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.78 
 
 
566 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  26.98 
 
 
512 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  26.44 
 
 
541 aa  104  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  26.53 
 
 
472 aa  105  3e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  29.1 
 
 
528 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  28.05 
 
 
567 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  25.88 
 
 
524 aa  104  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  28.05 
 
 
567 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  28.8 
 
 
534 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  24.95 
 
 
505 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  26.28 
 
 
505 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  26.98 
 
 
512 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  26.98 
 
 
512 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  26.92 
 
 
512 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  27.54 
 
 
544 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  26.55 
 
 
512 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  28.18 
 
 
500 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  26.56 
 
 
525 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  26.63 
 
 
512 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  27.23 
 
 
505 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  26.63 
 
 
508 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
505 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
529 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
529 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
529 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  28.16 
 
 
516 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>