More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4185 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4185  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 518 aa  1003    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21790  apolipoprotein N-acyltransferase  53.2 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2349  apolipoprotein N-acyltransferase  44.31 
 
 		 539 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00106954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2703  apolipoprotein N-acyltransferase  41.47 
 
 		 536 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0493141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  41.06 
 
 		 517 aa  299  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  40.75 
 
 		 883 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2629  apolipoprotein N-acyltransferase  40.93 
 
 		 515 aa  280  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17898  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  38.89 
 
 		 541 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1533  apolipoprotein N-acyltransferase  38.63 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2863  apolipoprotein N-acyltransferase  38.2 
 
 		 535 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2388  apolipoprotein N-acyltransferase  42.95 
 
 		 543 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733975  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2269  apolipoprotein N-acyltransferase  42.58 
 
 		 559 aa  266  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937964  normal  0.125706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1762  apolipoprotein N-acyltransferase  36.94 
 
 		 527 aa  266  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2199  apolipoprotein N-acyltransferase  40.71 
 
 		 522 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2539  apolipoprotein N-acyltransferase  37.13 
 
 		 573 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524723  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2502  apolipoprotein N-acyltransferase  37.13 
 
 		 573 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.765014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2547  apolipoprotein N-acyltransferase  37.13 
 
 		 573 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1210  apolipoprotein N-acyltransferase  40.15 
 
 		 540 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3419  apolipoprotein N-acyltransferase  37.25 
 
 		 551 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3117  apolipoprotein N-acyltransferase  38.11 
 
 		 560 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0355571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5817  Apolipoprotein N-acyltransferase-like protein  40.04 
 
 		 547 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272998  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1890  apolipoprotein N-acyltransferase  40.25 
 
 		 593 aa  255  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1874  apolipoprotein N-acyltransferase  39.76 
 
 		 552 aa  250  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2933  apolipoprotein N-acyltransferase  36.97 
 
 		 583 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000865373  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18480  apolipoprotein N-acyltransferase  38.31 
 
 		 524 aa  240  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2272  apolipoprotein N-acyltransferase  39.18 
 
 		 547 aa  239  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000100111  hitchhiker  0.0030022 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4561  apolipoprotein N-acyltransferase  37.58 
 
 		 559 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  38.36 
 
 		 566 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4508  apolipoprotein N-acyltransferase  36.54 
 
 		 568 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1294  apolipoprotein N-acyltransferase  36.76 
 
 		 518 aa  229  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.93193  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2064  apolipoprotein N-acyltransferase  39.54 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0246959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  34.09 
 
 		 874 aa  217  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2666  apolipoprotein N-acyltransferase  35.12 
 
 		 551 aa  217  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14080  apolipoprotein N-acyltransferase  36.4 
 
 		 533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225972  normal  0.302193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3946  apolipoprotein N-acyltransferase  31.73 
 
 		 606 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2204  apolipoprotein N-acyltransferase  35.63 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341559  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25890  apolipoprotein N-acyltransferase  34.87 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15980  apolipoprotein N-acyltransferase  33.74 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1775  apolipoprotein N-acyltransferase  38.72 
 
 		 606 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.629044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  29.67 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  28.17 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 		 489 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  28.85 
 
 		 509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  25.5 
 
 		 506 aa  137  6.0000000000000005e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  26.48 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  27.4 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  29.69 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  25.16 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  28.48 
 
 		 505 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 		 505 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  29.61 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  27.7 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  31.52 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  29.15 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  28.49 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  29.03 
 
 		 516 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  27.52 
 
 		 524 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  29.03 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  27.2 
 
 		 518 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  28.11 
 
 		 518 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.22 
 
 		 516 aa  123  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  25.92 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  28.17 
 
 		 521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  26.09 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  29.55 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  28.84 
 
 		 505 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  25.53 
 
 		 529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  25.53 
 
 		 529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  26.18 
 
 		 512 aa  120  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  26.18 
 
 		 512 aa  120  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  25.53 
 
 		 529 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  25.53 
 
 		 529 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  25.69 
 
 		 512 aa  119  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  25.53 
 
 		 529 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  27.58 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  26.01 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  25.82 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  25.44 
 
 		 506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  27.29 
 
 		 537 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  24.65 
 
 		 512 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  24.69 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  26 
 
 		 501 aa  117  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  31.42 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  25.92 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  26.17 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  25.9 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  25.9 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  25.9 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  26.17 
 
 		 508 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  31.34 
 
 		 509 aa  114  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  23.68 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  27.12 
 
 		 497 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  27.76 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  27.59 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  25.65 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  24.58 
 
 		 553 aa  111  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>