More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1890 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1890  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
593 aa  1148    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4561  apolipoprotein N-acyltransferase  61.82 
 
 
559 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2703  apolipoprotein N-acyltransferase  52.01 
 
 
536 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0493141  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2269  apolipoprotein N-acyltransferase  50.52 
 
 
559 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937964  normal  0.125706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2349  apolipoprotein N-acyltransferase  46.88 
 
 
539 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00106954  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2388  apolipoprotein N-acyltransferase  50 
 
 
543 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733975  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1874  apolipoprotein N-acyltransferase  44.8 
 
 
552 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  47.2 
 
 
883 aa  353  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  45.6 
 
 
541 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2933  apolipoprotein N-acyltransferase  48.74 
 
 
583 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000865373  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14080  apolipoprotein N-acyltransferase  41.68 
 
 
533 aa  337  5e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225972  normal  0.302193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1294  apolipoprotein N-acyltransferase  42.39 
 
 
518 aa  332  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.93193  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18480  apolipoprotein N-acyltransferase  46.34 
 
 
524 aa  331  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1210  apolipoprotein N-acyltransferase  43.19 
 
 
540 aa  330  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  44.33 
 
 
517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2272  apolipoprotein N-acyltransferase  43.75 
 
 
547 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000100111  hitchhiker  0.0030022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3419  apolipoprotein N-acyltransferase  41.91 
 
 
551 aa  316  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  41.3 
 
 
566 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3117  apolipoprotein N-acyltransferase  42.91 
 
 
560 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0355571  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2629  apolipoprotein N-acyltransferase  47.15 
 
 
515 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17898  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2863  apolipoprotein N-acyltransferase  41.85 
 
 
535 aa  308  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3946  apolipoprotein N-acyltransferase  39.88 
 
 
606 aa  306  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2539  apolipoprotein N-acyltransferase  42.86 
 
 
573 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524723  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2502  apolipoprotein N-acyltransferase  42.86 
 
 
573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.765014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2547  apolipoprotein N-acyltransferase  42.86 
 
 
573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464192  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2064  apolipoprotein N-acyltransferase  43.74 
 
 
508 aa  304  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0246959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4508  apolipoprotein N-acyltransferase  43.5 
 
 
568 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2666  apolipoprotein N-acyltransferase  39.86 
 
 
551 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21790  apolipoprotein N-acyltransferase  39.46 
 
 
551 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2199  apolipoprotein N-acyltransferase  40.5 
 
 
522 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5817  Apolipoprotein N-acyltransferase-like protein  41.46 
 
 
547 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272998  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  40.89 
 
 
874 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2204  apolipoprotein N-acyltransferase  40.6 
 
 
552 aa  270  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4185  apolipoprotein N-acyltransferase  41.25 
 
 
518 aa  268  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1762  apolipoprotein N-acyltransferase  36.89 
 
 
527 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1533  apolipoprotein N-acyltransferase  39.26 
 
 
581 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25890  apolipoprotein N-acyltransferase  42.41 
 
 
528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15980  apolipoprotein N-acyltransferase  37.45 
 
 
546 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1775  apolipoprotein N-acyltransferase  42.23 
 
 
606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.629044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  27.83 
 
 
512 aa  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  27.64 
 
 
512 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.64 
 
 
512 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  27.46 
 
 
512 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  27.46 
 
 
512 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  27.54 
 
 
512 aa  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
512 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  27.99 
 
 
512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  32.84 
 
 
522 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  27.74 
 
 
508 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  30.34 
 
 
542 aa  143  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  25.79 
 
 
529 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  27.5 
 
 
509 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  26.02 
 
 
529 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  25.84 
 
 
529 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  25.84 
 
 
529 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  24.6 
 
 
501 aa  140  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  26.02 
 
 
529 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  28.06 
 
 
506 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  28.41 
 
 
524 aa  139  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  30.51 
 
 
506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  26.72 
 
 
492 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
512 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
524 aa  135  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  25.38 
 
 
506 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  26.96 
 
 
523 aa  135  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  27.14 
 
 
506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  26.9 
 
 
509 aa  133  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.45 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  28.49 
 
 
522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  27.75 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  29.42 
 
 
509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  29.47 
 
 
489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
516 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  28.07 
 
 
521 aa  130  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  28.29 
 
 
511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  27.29 
 
 
509 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  28.29 
 
 
525 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  30.23 
 
 
505 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  30.49 
 
 
505 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  29.89 
 
 
505 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  32.04 
 
 
520 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
514 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  27.48 
 
 
519 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  25.74 
 
 
518 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  25.93 
 
 
520 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  27.14 
 
 
516 aa  124  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  25.63 
 
 
505 aa  124  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  29.14 
 
 
528 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  24.73 
 
 
510 aa  124  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
505 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  27.07 
 
 
516 aa  123  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  28.02 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  28.02 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  28.02 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  27.03 
 
 
511 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  27.89 
 
 
537 aa  120  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  30.92 
 
 
550 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  28.22 
 
 
507 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  26.16 
 
 
553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  27.82 
 
 
511 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>