287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4561 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4561  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
559 aa  1095    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1890  apolipoprotein N-acyltransferase  62.12 
 
 
593 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2703  apolipoprotein N-acyltransferase  47.89 
 
 
536 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0493141  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2269  apolipoprotein N-acyltransferase  47.69 
 
 
559 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937964  normal  0.125706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2388  apolipoprotein N-acyltransferase  48.64 
 
 
543 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733975  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1874  apolipoprotein N-acyltransferase  45.67 
 
 
552 aa  343  5.999999999999999e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  44.27 
 
 
541 aa  343  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2349  apolipoprotein N-acyltransferase  44.05 
 
 
539 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00106954  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14080  apolipoprotein N-acyltransferase  42.09 
 
 
533 aa  330  5.0000000000000004e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225972  normal  0.302193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  44.16 
 
 
883 aa  327  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2933  apolipoprotein N-acyltransferase  46.3 
 
 
583 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000865373  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  43.14 
 
 
517 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18480  apolipoprotein N-acyltransferase  42.6 
 
 
524 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1210  apolipoprotein N-acyltransferase  42.44 
 
 
540 aa  320  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2272  apolipoprotein N-acyltransferase  44.15 
 
 
547 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000100111  hitchhiker  0.0030022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3117  apolipoprotein N-acyltransferase  43.16 
 
 
560 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0355571  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2863  apolipoprotein N-acyltransferase  39.96 
 
 
535 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1294  apolipoprotein N-acyltransferase  42.18 
 
 
518 aa  299  9e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.93193  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2539  apolipoprotein N-acyltransferase  43.02 
 
 
573 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524723  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2502  apolipoprotein N-acyltransferase  43.02 
 
 
573 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.765014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2547  apolipoprotein N-acyltransferase  43.02 
 
 
573 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464192  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2629  apolipoprotein N-acyltransferase  44.56 
 
 
515 aa  296  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2064  apolipoprotein N-acyltransferase  43.21 
 
 
508 aa  294  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0246959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3419  apolipoprotein N-acyltransferase  42.31 
 
 
551 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4508  apolipoprotein N-acyltransferase  41.29 
 
 
568 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21790  apolipoprotein N-acyltransferase  40.22 
 
 
551 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3946  apolipoprotein N-acyltransferase  36.94 
 
 
606 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5817  Apolipoprotein N-acyltransferase-like protein  40.51 
 
 
547 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272998  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  37.63 
 
 
566 aa  267  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  40.88 
 
 
874 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2666  apolipoprotein N-acyltransferase  39.57 
 
 
551 aa  260  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2199  apolipoprotein N-acyltransferase  38.11 
 
 
522 aa  255  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2204  apolipoprotein N-acyltransferase  40.54 
 
 
552 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1762  apolipoprotein N-acyltransferase  36.44 
 
 
527 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4185  apolipoprotein N-acyltransferase  37.58 
 
 
518 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1533  apolipoprotein N-acyltransferase  35.99 
 
 
581 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25890  apolipoprotein N-acyltransferase  40 
 
 
528 aa  237  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15980  apolipoprotein N-acyltransferase  35.59 
 
 
546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1775  apolipoprotein N-acyltransferase  39.87 
 
 
606 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.629044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 
529 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 
521 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  27.94 
 
 
509 aa  139  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 
529 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 
529 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  27.51 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  27.16 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  27 
 
 
512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  27 
 
 
512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  26.82 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.15 
 
 
512 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 
509 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  27.16 
 
 
512 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  27.15 
 
 
512 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  27.16 
 
 
515 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  27.16 
 
 
515 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  27.16 
 
 
515 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  29.04 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  26.94 
 
 
509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.63 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  26.87 
 
 
519 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 
521 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  26.87 
 
 
516 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  26.45 
 
 
516 aa  127  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  29.91 
 
 
522 aa  126  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  31.17 
 
 
506 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  25.94 
 
 
518 aa  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  27.93 
 
 
505 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  23.66 
 
 
510 aa  123  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  26.96 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  25.87 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  26.96 
 
 
508 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  23.58 
 
 
518 aa  121  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  27.66 
 
 
505 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  29.52 
 
 
489 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  28.94 
 
 
507 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  29.08 
 
 
542 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  27.29 
 
 
505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  23.35 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  25.71 
 
 
506 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
507 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  27.16 
 
 
507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  27.31 
 
 
505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.94 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 
525 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  25.32 
 
 
506 aa  118  3.9999999999999997e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  28.31 
 
 
521 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  25.61 
 
 
509 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  24.9 
 
 
537 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 
477 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  29.63 
 
 
550 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  27.99 
 
 
503 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  27.49 
 
 
514 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  25.19 
 
 
511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  24.57 
 
 
537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  25.12 
 
 
505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  27.59 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  28.01 
 
 
528 aa  112  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  22.69 
 
 
492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>