More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25890  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
528 aa  1020    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1890  apolipoprotein N-acyltransferase  44 
 
 
593 aa  297  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14080  apolipoprotein N-acyltransferase  40.36 
 
 
533 aa  297  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225972  normal  0.302193 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4561  apolipoprotein N-acyltransferase  41.21 
 
 
559 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  36.71 
 
 
541 aa  274  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2703  apolipoprotein N-acyltransferase  40.82 
 
 
536 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0493141  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2388  apolipoprotein N-acyltransferase  42.56 
 
 
543 aa  266  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733975  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2269  apolipoprotein N-acyltransferase  41.88 
 
 
559 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937964  normal  0.125706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2349  apolipoprotein N-acyltransferase  39.59 
 
 
539 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00106954  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1874  apolipoprotein N-acyltransferase  40.38 
 
 
552 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1294  apolipoprotein N-acyltransferase  37.85 
 
 
518 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.93193  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2199  apolipoprotein N-acyltransferase  36.81 
 
 
522 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  36.96 
 
 
517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21790  apolipoprotein N-acyltransferase  36.78 
 
 
551 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2933  apolipoprotein N-acyltransferase  39.1 
 
 
583 aa  236  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000865373  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18480  apolipoprotein N-acyltransferase  37 
 
 
524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3117  apolipoprotein N-acyltransferase  36.31 
 
 
560 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0355571  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2539  apolipoprotein N-acyltransferase  36.13 
 
 
573 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524723  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4185  apolipoprotein N-acyltransferase  34.87 
 
 
518 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2502  apolipoprotein N-acyltransferase  36.13 
 
 
573 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.765014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2547  apolipoprotein N-acyltransferase  36.13 
 
 
573 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464192  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15980  apolipoprotein N-acyltransferase  35.4 
 
 
546 aa  226  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1210  apolipoprotein N-acyltransferase  37.15 
 
 
540 aa  224  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2666  apolipoprotein N-acyltransferase  37.15 
 
 
551 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2629  apolipoprotein N-acyltransferase  37.29 
 
 
515 aa  223  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3419  apolipoprotein N-acyltransferase  35.53 
 
 
551 aa  223  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2064  apolipoprotein N-acyltransferase  38.93 
 
 
508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0246959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  36.73 
 
 
874 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  35.33 
 
 
566 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4508  apolipoprotein N-acyltransferase  34.26 
 
 
568 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3946  apolipoprotein N-acyltransferase  33.59 
 
 
606 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2863  apolipoprotein N-acyltransferase  33.46 
 
 
535 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  35.23 
 
 
883 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2204  apolipoprotein N-acyltransferase  37.26 
 
 
552 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5817  Apolipoprotein N-acyltransferase-like protein  34.99 
 
 
547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272998  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2272  apolipoprotein N-acyltransferase  36.58 
 
 
547 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000100111  hitchhiker  0.0030022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1533  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 
581 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1762  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
527 aa  181  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  28.71 
 
 
512 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  28.52 
 
 
512 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  28.88 
 
 
512 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  28.88 
 
 
512 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  28.52 
 
 
512 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  28.88 
 
 
512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  28.88 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  28.68 
 
 
512 aa  160  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  28.68 
 
 
508 aa  160  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  30.16 
 
 
509 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  29.64 
 
 
509 aa  156  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1775  apolipoprotein N-acyltransferase  39.62 
 
 
606 aa  154  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.629044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  27.88 
 
 
529 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
529 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
529 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
529 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
529 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  27.26 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 
519 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  29.44 
 
 
518 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  29.09 
 
 
509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  29.62 
 
 
511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  26.49 
 
 
520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 
516 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.57 
 
 
512 aa  147  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  28.93 
 
 
525 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 
516 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 
537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  32.71 
 
 
524 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 
503 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  28.38 
 
 
515 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  28.38 
 
 
515 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  28.38 
 
 
515 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  24.67 
 
 
515 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  29.96 
 
 
507 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  34.82 
 
 
500 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 
503 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  25.48 
 
 
511 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  30.11 
 
 
507 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  29.84 
 
 
521 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  28 
 
 
509 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  28.97 
 
 
521 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  26.03 
 
 
519 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  29.07 
 
 
506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  30.26 
 
 
528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  25.78 
 
 
506 aa  137  3.0000000000000003e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  28.12 
 
 
542 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  29.36 
 
 
550 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  25.79 
 
 
532 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  29.78 
 
 
507 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2579  apolipoprotein N-acyltransferase  28.54 
 
 
511 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.170018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  29.28 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  28.81 
 
 
477 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  26.11 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  28.2 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  31.05 
 
 
523 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  26.93 
 
 
504 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  34.26 
 
 
505 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  28.19 
 
 
537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  25.64 
 
 
553 aa  130  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  30.11 
 
 
479 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  26.15 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>