More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0358 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0358  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
505 aa  1019    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  31.51 
 
 
542 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
506 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
509 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  29.33 
 
 
509 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  29.64 
 
 
525 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  29.18 
 
 
510 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  28.38 
 
 
509 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  29.69 
 
 
507 aa  157  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  29.83 
 
 
507 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
516 aa  156  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  26.94 
 
 
515 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  29 
 
 
529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  27.71 
 
 
523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  27.02 
 
 
521 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 
516 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  28.93 
 
 
518 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  27.78 
 
 
521 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  27.74 
 
 
519 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  26.06 
 
 
537 aa  150  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  29.48 
 
 
477 aa  149  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.29 
 
 
512 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  27.09 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  29.57 
 
 
522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  27.1 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  27.1 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  27.1 
 
 
529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  27.1 
 
 
529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  27.92 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  27.43 
 
 
529 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  27.95 
 
 
516 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  27.49 
 
 
512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  28.49 
 
 
526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
512 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
512 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
512 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  28.93 
 
 
515 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  30.62 
 
 
528 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  28.93 
 
 
515 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  28.93 
 
 
515 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  26.22 
 
 
514 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  28.14 
 
 
489 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  27.22 
 
 
511 aa  144  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.24 
 
 
512 aa  143  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  27.24 
 
 
508 aa  143  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1141  apolipoprotein N-acyltransferase  31.91 
 
 
464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0258943  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  27.69 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  30.46 
 
 
523 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  30.46 
 
 
523 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2579  apolipoprotein N-acyltransferase  28.72 
 
 
511 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.170018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  25.05 
 
 
519 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  26.94 
 
 
518 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  24.24 
 
 
505 aa  139  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  27.58 
 
 
509 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  27 
 
 
506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  25.54 
 
 
501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  33.82 
 
 
510 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  25.7 
 
 
537 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  26.85 
 
 
511 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.82 
 
 
479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  31.64 
 
 
524 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  31.64 
 
 
524 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  28.64 
 
 
505 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 
534 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  27.5 
 
 
502 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  28.64 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  31.27 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  31.64 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  28.18 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  28.74 
 
 
552 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  25.63 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  28.92 
 
 
507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  25.57 
 
 
524 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  25.34 
 
 
497 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  30.47 
 
 
541 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  28.15 
 
 
505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  27.18 
 
 
524 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  28.12 
 
 
506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  29.04 
 
 
507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  34.21 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  24.9 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  27.57 
 
 
507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  27.36 
 
 
524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  25.52 
 
 
541 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 
510 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  26.9 
 
 
504 aa  127  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  28.19 
 
 
520 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  27.71 
 
 
522 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  26.14 
 
 
513 aa  125  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  29.15 
 
 
505 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  26.68 
 
 
497 aa  124  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  28.42 
 
 
506 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  28.27 
 
 
536 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  28.05 
 
 
535 aa  123  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  27.08 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1374  apolipoprotein N-acyltransferase  27.39 
 
 
516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  29.22 
 
 
521 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  28.48 
 
 
534 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  28.72 
 
 
557 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>