91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0799 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0799  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  100 
 
 		 328 aa  671    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1173  dihydroorotate dehydrogenase 1A  26.71 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000817907  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1279  dihydroorotate dehydrogenase 1A  25.9 
 
 		 312 aa  87.8  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.066651  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0264  dihydroorotate dehydrogenase 1A  24.7 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0328466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1644  dihydroorotate dehydrogenase 1A  25.85 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95904  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48112  predicted protein  28 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.230044  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0507  dihydroorotate dehydrogenase 1A  28.47 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000369994  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0982  dihydroorotate dehydrogenase/oxidoreductase, FAD-binding  23.72 
 
 		 591 aa  59.7  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0423353  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.63 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.52 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.89 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.63 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.89 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1698  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.55 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.05 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  32.8 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.02 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1674  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.75 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.56 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1110  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.88 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.229452  normal  0.46967 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.66 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.62 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0593  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.58 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00422459  hitchhiker  0.00121069 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1154  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.11 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.1 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.5 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1185  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  24.03 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  30.05 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  29.76 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.73 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.54 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.11 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.11 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.73 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.09 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.1 
 
 		 340 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.24 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.24 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.24 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.24 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.24 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  30.06 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.81 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.01 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.11 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.68 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.32 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.76 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.01 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.41 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  29.89 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.14 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.81 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  29.31 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1742  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.51 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  27.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  27.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  25.27 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  29.24 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04130  Dihydroorotate dehydrogenase, mitochondrial precursor, putative  25.57 
 
 		 591 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0796  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.66 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.04 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  27.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.42 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.96 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.88 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.8 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.49 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  29.28 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.42 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.27 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1244  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.66 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.42 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  24.34 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.98 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1342  dihydroorotate oxidase A  26.09 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  25.42 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.41 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5282  dihydroorotate oxidase  25.47 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.72 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.72 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.27 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  24.74 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  25 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.34 
 
 		 356 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>