More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1743 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  100 
 
 
363 aa  742    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.57 
 
 
360 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.79 
 
 
304 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.46 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.82 
 
 
304 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.62 
 
 
304 aa  169  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.53 
 
 
305 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.81 
 
 
444 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.22 
 
 
305 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.13 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  31.27 
 
 
432 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.89 
 
 
305 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.8 
 
 
444 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.27 
 
 
304 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.23 
 
 
435 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.65 
 
 
425 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.65 
 
 
424 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.86 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.86 
 
 
437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.29 
 
 
437 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.29 
 
 
437 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.88 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.11 
 
 
435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.29 
 
 
435 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.83 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.44 
 
 
299 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.8 
 
 
436 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.22 
 
 
424 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.72 
 
 
424 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.72 
 
 
411 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.97 
 
 
424 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.72 
 
 
411 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.72 
 
 
411 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.72 
 
 
411 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.72 
 
 
411 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09420  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  35.06 
 
 
304 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.22 
 
 
305 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.14 
 
 
411 aa  142  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.14 
 
 
411 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.14 
 
 
411 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.14 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.14 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.14 
 
 
411 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  28.14 
 
 
411 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.33 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.14 
 
 
411 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.64 
 
 
424 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.14 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.87 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.56 
 
 
304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.38 
 
 
439 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.39 
 
 
429 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.82 
 
 
436 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.53 
 
 
309 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.55 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.25 
 
 
435 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.55 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.55 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.55 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.55 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.55 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.41 
 
 
434 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.55 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3443  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.15 
 
 
424 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.03 
 
 
437 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1363  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.68 
 
 
432 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.709069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.93 
 
 
426 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.22 
 
 
309 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.07 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.2 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.74 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.77 
 
 
313 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.48 
 
 
437 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.92 
 
 
434 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.92 
 
 
434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3449  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.53 
 
 
437 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.79 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0296  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.32 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.66 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  33.11 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1755  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.22 
 
 
305 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1495  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.68 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32 
 
 
304 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.16 
 
 
434 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0967  dihydropyrimidine dehydrogenase  29.62 
 
 
442 aa  133  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.584052  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.75 
 
 
422 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.57 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.57 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.45 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  28.12 
 
 
390 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2712  dihydropyrimidine dehydrogenase  28.35 
 
 
434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462922  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  30.74 
 
 
417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.74 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2361  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.58 
 
 
437 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.79 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.55 
 
 
307 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.02 
 
 
398 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1300  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.57 
 
 
307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.74 
 
 
324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.23 
 
 
352 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>