285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2025 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  100 
 
 		 398 aa  821    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.48 
 
 		 422 aa  292  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.21 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.66 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.07 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.9 
 
 		 434 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.82 
 
 		 437 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.82 
 
 		 437 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.9 
 
 		 434 aa  275  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.82 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.82 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.92 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.66 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.82 
 
 		 444 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.56 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2712  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.73 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462922  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.41 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.69 
 
 		 426 aa  266  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1363  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.54 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.709069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3443  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.01 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  37.91 
 
 		 434 aa  259  8e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.1 
 
 		 441 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.55 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.85 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.55 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.59 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.59 
 
 		 424 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.64 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.23 
 
 		 437 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.89 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.83 
 
 		 435 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.58 
 
 		 437 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  37.77 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3449  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.58 
 
 		 437 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.09 
 
 		 424 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.68 
 
 		 411 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.68 
 
 		 411 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.68 
 
 		 411 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.23 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.68 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  34.68 
 
 		 411 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.68 
 
 		 411 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.83 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.68 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.68 
 
 		 411 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0967  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.38 
 
 		 442 aa  249  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.43 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.19 
 
 		 437 aa  249  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2361  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.13 
 
 		 437 aa  249  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0296  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.38 
 
 		 436 aa  249  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.68 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.68 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.68 
 
 		 411 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.68 
 
 		 411 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  35.09 
 
 		 432 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.18 
 
 		 411 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1889  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.63 
 
 		 461 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0110983  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4151  dihydropyrimidine dehydrogenase  37.4 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.89 
 
 		 381 aa  176  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.05 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.69 
 
 		 305 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.08 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.92 
 
 		 304 aa  149  9e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.08 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.43 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.02 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.21 
 
 		 300 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  28.19 
 
 		 390 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.38 
 
 		 301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.22 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.15 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.68 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.68 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.68 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.68 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.68 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.68 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.68 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.68 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.68 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.13 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1110  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.35 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.229452  normal  0.46967 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1154  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.61 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.11 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.1 
 
 		 309 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.66 
 
 		 308 aa  103  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.35 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1742  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.93 
 
 		 295 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.64 
 
 		 305 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.85 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.64 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.91 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.54 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0947  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  34.55 
 
 		 307 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302447  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0796  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.14 
 
 		 295 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2822  dihydroorotate dehydrogenase 1  30.57 
 
 		 331 aa  99.4  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0209539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0056  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  33.63 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.62 
 
 		 307 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.66 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.55 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>