176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2064 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  94.53 
 
 
330 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
330 aa  677    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0729  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.84 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1262  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.88 
 
 
343 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3045  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.19 
 
 
343 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.675973  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2635  dihydroorotate dehydrogenase  57.27 
 
 
355 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4370  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.47 
 
 
347 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0185  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.26 
 
 
339 aa  364  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.373887 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0190  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.26 
 
 
339 aa  364  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2839  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 
336 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.54 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2385  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.24 
 
 
340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2467  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.02 
 
 
336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7745  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0606  dihydroorotate dehydrogenase  46.18 
 
 
332 aa  298  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4110  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.3 
 
 
336 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000291648  normal  0.122878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0808  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.58 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335542  normal  0.0281736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2988  dihydroorotate dehydrogenase  44.55 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16810  Dihydroorotate dehydrogenase  44.58 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0762  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.72 
 
 
328 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0813  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.11 
 
 
328 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.362668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0809  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.11 
 
 
328 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0801526  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4864  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 
340 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4953  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 
340 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5232  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 
340 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.768004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2219  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.89 
 
 
328 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32415  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.48 
 
 
328 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000361805  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2445  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.18 
 
 
375 aa  237  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2084  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.84 
 
 
328 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2055  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.23 
 
 
326 aa  203  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.100405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.18 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  29.91 
 
 
390 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.66 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.23 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.81 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.82 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.91 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.61 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.61 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.61 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.61 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.61 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.61 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.61 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.38 
 
 
411 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.3 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.3 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.84 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.07 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.07 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.07 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.07 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  24.07 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.07 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  24.15 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.96 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.96 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  26.96 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.13 
 
 
311 aa  69.3  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.68 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.83 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.45 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.47 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.46 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.97 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.46 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.46 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.46 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.77 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.22 
 
 
411 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.56 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0969  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.04 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  23.64 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.75 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.3 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.92 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2402  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.51 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.350257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.77 
 
 
422 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.4 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3483  dihydroorotate dehydrogenase  27.6 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.825522  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.04 
 
 
300 aa  63.2  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.09 
 
 
322 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.67 
 
 
304 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.58 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.78 
 
 
441 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  25.32 
 
 
417 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.23 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.96 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.31 
 
 
436 aa  60.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.95 
 
 
444 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.29 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  20.76 
 
 
360 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1197  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.7 
 
 
299 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.89 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.07 
 
 
437 aa  59.7  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.66 
 
 
437 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.01 
 
 
436 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  22.15 
 
 
461 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.7 
 
 
429 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.34 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>