More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1390 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  100 
 
 
303 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  44.48 
 
 
299 aa  252  5.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  43.05 
 
 
300 aa  246  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  43.38 
 
 
304 aa  246  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  42.57 
 
 
301 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  42.48 
 
 
304 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  42.48 
 
 
304 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  41.5 
 
 
304 aa  218  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  39.29 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.86 
 
 
305 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  40.07 
 
 
305 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.29 
 
 
305 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09420  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  39.09 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0593  dihydroorotate dehydrogenase 1B  40.96 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00422459  hitchhiker  0.00121069 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0796  dihydroorotate dehydrogenase 1B  41.64 
 
 
295 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1154  dihydroorotate dehydrogenase 1B  44.18 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43388  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1161  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.36 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.109193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40 
 
 
300 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.53 
 
 
304 aa  195  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35.31 
 
 
314 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1279  hypothetical protein  36.51 
 
 
302 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1742  dihydroorotate dehydrogenase 1B  43.02 
 
 
295 aa  192  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.88 
 
 
322 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  40.45 
 
 
321 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.64 
 
 
305 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1244  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.8 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  40.58 
 
 
313 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.58 
 
 
324 aa  188  9e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1300  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35.87 
 
 
307 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1110  dihydroorotate dehydrogenase 1B  39.71 
 
 
296 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.229452  normal  0.46967 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1814  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.95 
 
 
302 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00465279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.76 
 
 
304 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.31 
 
 
305 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  35.41 
 
 
303 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  37 
 
 
352 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  36.36 
 
 
314 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  35.26 
 
 
417 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.33 
 
 
307 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.64 
 
 
305 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.58 
 
 
310 aa  185  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1663  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.33 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000377649  hitchhiker  0.00130858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  40.22 
 
 
313 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.2 
 
 
297 aa  182  9.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  39.18 
 
 
309 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.81 
 
 
309 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.81 
 
 
309 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.81 
 
 
309 aa  178  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.81 
 
 
309 aa  178  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.81 
 
 
309 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1382  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.08 
 
 
299 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0126255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.81 
 
 
309 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.81 
 
 
309 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.26 
 
 
304 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.32 
 
 
300 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  39.41 
 
 
309 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.43 
 
 
309 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1755  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.96 
 
 
305 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1197  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.75 
 
 
299 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.35 
 
 
309 aa  175  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2200  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.13 
 
 
308 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0947  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  37.67 
 
 
307 aa  175  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0785  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35.22 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11880  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  34.54 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.0175843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.67 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0657  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.34 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.345915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1495  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.55 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2850  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.84 
 
 
302 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3426  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  33.44 
 
 
312 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.03 
 
 
330 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2846  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.6 
 
 
302 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2143  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.3 
 
 
308 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07830  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  34.98 
 
 
305 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.221427  normal  0.399938 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0163  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.99 
 
 
311 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000375439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.32 
 
 
308 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2822  dihydroorotate dehydrogenase 1  33.45 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0209539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0056  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  36.68 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1572  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.33 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0950593  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1065  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.49 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.257669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  32.36 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0072  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.15 
 
 
307 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3010  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.39 
 
 
336 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0061654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0019  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35.96 
 
 
304 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1769  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.11 
 
 
311 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0721  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35 
 
 
307 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0614  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.7 
 
 
314 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5904  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.66 
 
 
325 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5681  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.66 
 
 
325 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00753595  normal  0.0457266 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0729  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.55 
 
 
303 aa  156  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000867503 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.48 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1059  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  33.97 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1783  dihydroorotate dehydrogenase 1  33.33 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0811  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.9 
 
 
308 aa  152  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0183468  normal  0.536442 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0593  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.08 
 
 
314 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0553  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.11 
 
 
309 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.86 
 
 
432 aa  151  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2402  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.24 
 
 
303 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.350257  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1296  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.68 
 
 
351 aa  149  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.717011  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2810  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.94 
 
 
324 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1596  dihydroorotate dehydrogenase 1  35.02 
 
 
331 aa  149  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1475  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  33.45 
 
 
304 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>