186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0606 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0606  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  671    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2635  dihydroorotate dehydrogenase  47.27 
 
 
355 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.4 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3045  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 
343 aa  305  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.675973  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0729  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.55 
 
 
334 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.18 
 
 
330 aa  298  6e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.15 
 
 
333 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1262  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.33 
 
 
343 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0190  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 
339 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0185  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 
339 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.373887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2839  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.6 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2385  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2467  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.68 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7745  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4370  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.81 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2988  dihydroorotate dehydrogenase  44.01 
 
 
337 aa  255  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0808  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.68 
 
 
328 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335542  normal  0.0281736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4110  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.56 
 
 
336 aa  249  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000291648  normal  0.122878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4864  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.93 
 
 
340 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4953  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.93 
 
 
340 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5232  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.93 
 
 
340 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.768004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16810  Dihydroorotate dehydrogenase  41.09 
 
 
332 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0809  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.73 
 
 
328 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0801526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0813  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.43 
 
 
328 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.362668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0762  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.21 
 
 
328 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2219  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.53 
 
 
328 aa  218  8.999999999999998e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32415  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2055  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.66 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.100405 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2445  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.58 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.65 
 
 
328 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000361805  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2084  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.02 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.65 
 
 
381 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  33.85 
 
 
390 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.84 
 
 
363 aa  96.3  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.3 
 
 
299 aa  93.6  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.03 
 
 
398 aa  92.8  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.72 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  22.57 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.06 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.73 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.27 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.6 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  22.77 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1572  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.23 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0950593  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.51 
 
 
434 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.74 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.53 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.22 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.12 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.02 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.82 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.78 
 
 
425 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.01 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.64 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.64 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.64 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.64 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.64 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.64 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.64 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0163  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.08 
 
 
311 aa  63.2  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000375439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.81 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.64 
 
 
309 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  22.51 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.21 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.64 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.88 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.95 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.62 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.35 
 
 
424 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.73 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.75 
 
 
424 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.55 
 
 
304 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.92 
 
 
434 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.5 
 
 
411 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.5 
 
 
411 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.5 
 
 
411 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.5 
 
 
411 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.8 
 
 
304 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.5 
 
 
411 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.69 
 
 
426 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.15 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.81 
 
 
436 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.61 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.74 
 
 
435 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.43 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.75 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.46 
 
 
424 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.67 
 
 
435 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.67 
 
 
437 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.67 
 
 
435 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.98 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.67 
 
 
437 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3483  dihydroorotate dehydrogenase  28.83 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.825522  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.67 
 
 
437 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.73 
 
 
436 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.17 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.37 
 
 
435 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.3 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.6 
 
 
305 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.05 
 
 
444 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  25 
 
 
321 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>