145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2084 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2084  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
328 aa  671    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2445  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.46 
 
 
375 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2219  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.63 
 
 
328 aa  409  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32415  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.06 
 
 
328 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000361805  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2055  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.92 
 
 
326 aa  253  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.100405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4110  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.36 
 
 
336 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000291648  normal  0.122878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3045  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.27 
 
 
343 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.675973  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0808  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.74 
 
 
328 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335542  normal  0.0281736 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 
333 aa  241  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0762  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.43 
 
 
328 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0809  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.81 
 
 
328 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0801526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0813  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.81 
 
 
328 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.362668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.84 
 
 
330 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.53 
 
 
330 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1262  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.23 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2635  dihydroorotate dehydrogenase  37.99 
 
 
355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4864  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.43 
 
 
340 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4953  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.43 
 
 
340 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5232  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.12 
 
 
340 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.768004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4370  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.46 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0729  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.93 
 
 
334 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0185  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.08 
 
 
339 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.373887 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0190  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.08 
 
 
339 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2839  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.53 
 
 
336 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2467  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.52 
 
 
336 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7745  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0606  dihydroorotate dehydrogenase  33.02 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2988  dihydroorotate dehydrogenase  40.07 
 
 
337 aa  195  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2385  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.83 
 
 
340 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16810  Dihydroorotate dehydrogenase  34.86 
 
 
332 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.81 
 
 
381 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  29.97 
 
 
390 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.48 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.93 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.46 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.16 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.07 
 
 
422 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.46 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  25 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  25 
 
 
411 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  25 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  25 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  25 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  21.94 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  23.51 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  25 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3483  dihydroorotate dehydrogenase  27.78 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.825522  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
411 aa  62.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.69 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  24.69 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0163  dihydroorotate dehydrogenase 1B  20.99 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000375439  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1674  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.3 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.53 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.53 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.53 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.53 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.53 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.53 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.53 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.23 
 
 
425 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.31 
 
 
437 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.38 
 
 
411 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.53 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.72 
 
 
435 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.12 
 
 
432 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.16 
 
 
439 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.6 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.17 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.06 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.15 
 
 
424 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.38 
 
 
434 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.38 
 
 
434 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.1 
 
 
304 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3449  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.38 
 
 
437 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.07 
 
 
437 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.77 
 
 
437 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.53 
 
 
424 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.64 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.76 
 
 
424 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.18 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.53 
 
 
424 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.44 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  21.47 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1161  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.86 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.109193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.77 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.84 
 
 
424 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.77 
 
 
434 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  22.12 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.85 
 
 
437 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0967  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.15 
 
 
442 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.584052  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.4 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.37 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.79 
 
 
304 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.78 
 
 
304 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.33 
 
 
308 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>