179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4864 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4864  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
340 aa  675    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4953  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
340 aa  675    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5232  dihydroorotate dehydrogenase 2  97.94 
 
 
340 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.768004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4110  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.26 
 
 
336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000291648  normal  0.122878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.31 
 
 
333 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3045  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.54 
 
 
343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.675973  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1262  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.71 
 
 
343 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0190  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.2 
 
 
339 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0185  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.2 
 
 
339 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.373887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16810  Dihydroorotate dehydrogenase  49.07 
 
 
332 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4370  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.31 
 
 
347 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0729  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.62 
 
 
334 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2988  dihydroorotate dehydrogenase  47.87 
 
 
337 aa  279  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2635  dihydroorotate dehydrogenase  43.87 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0808  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.11 
 
 
328 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335542  normal  0.0281736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2467  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.32 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7745  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0809  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 
328 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0801526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0813  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.34 
 
 
328 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.362668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.14 
 
 
330 aa  265  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0762  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.73 
 
 
328 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 
330 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2385  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.11 
 
 
340 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2839  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.98 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0606  dihydroorotate dehydrogenase  43.93 
 
 
332 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2084  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.43 
 
 
328 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2219  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.51 
 
 
328 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32415  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2445  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.34 
 
 
375 aa  209  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.42 
 
 
328 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000361805  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2055  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.05 
 
 
326 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.100405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.39 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  31.29 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.97 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.6 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.77 
 
 
411 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.08 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.08 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.08 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.08 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.08 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  25.08 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.94 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.94 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.92 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.94 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.94 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.77 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.77 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.65 
 
 
432 aa  75.9  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.59 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.26 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.59 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.85 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.71 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.43 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0657  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.34 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.345915  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.57 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.35 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.84 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.56 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.9 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.35 
 
 
436 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.81 
 
 
311 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3483  dihydroorotate dehydrogenase  32.34 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.825522  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  21.94 
 
 
303 aa  60.1  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.28 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  21.09 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.64 
 
 
309 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.44 
 
 
322 aa  59.3  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.8 
 
 
301 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.51 
 
 
426 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.77 
 
 
434 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.47 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1769  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.62 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.17 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.17 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.17 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.17 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.17 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.17 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.17 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.17 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.07 
 
 
435 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.76 
 
 
429 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.94 
 
 
311 aa  56.6  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.17 
 
 
309 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5681  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.86 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00753595  normal  0.0457266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.78 
 
 
437 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.78 
 
 
437 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.78 
 
 
437 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.78 
 
 
435 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  27.31 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  22.87 
 
 
461 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.78 
 
 
435 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.78 
 
 
438 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.48 
 
 
436 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  22 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  23.72 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1161  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.34 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.109193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>