193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3045 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3045  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
343 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.675973  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1262  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.67 
 
 
343 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4370  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.82 
 
 
347 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0190  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.67 
 
 
339 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0185  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.67 
 
 
339 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.373887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.49 
 
 
330 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.19 
 
 
330 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0729  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.22 
 
 
334 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2635  dihydroorotate dehydrogenase  50.9 
 
 
355 aa  358  9e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.67 
 
 
333 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2385  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.78 
 
 
340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4110  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 
336 aa  318  7e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000291648  normal  0.122878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0808  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.79 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335542  normal  0.0281736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0809  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 
328 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0801526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0813  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 
328 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.362668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2467  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.25 
 
 
336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7745  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2988  dihydroorotate dehydrogenase  45.54 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0762  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.17 
 
 
328 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0606  dihydroorotate dehydrogenase  45.29 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2839  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.58 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4864  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.54 
 
 
340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4953  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.54 
 
 
340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5232  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 
340 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.768004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16810  Dihydroorotate dehydrogenase  42.6 
 
 
332 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2219  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.21 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32415  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2084  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.27 
 
 
328 aa  247  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.2 
 
 
328 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000361805  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2445  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.31 
 
 
375 aa  230  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2055  dihydroorotate dehydrogenase 2  32 
 
 
326 aa  208  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.100405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.91 
 
 
381 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  31.51 
 
 
390 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.16 
 
 
363 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.08 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.1 
 
 
398 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.28 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.76 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.86 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.41 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  26.07 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.32 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3426  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  24.78 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.6 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.89 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.53 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.04 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.22 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.38 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.51 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.31 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  22.88 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.23 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  21.33 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.62 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2361  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.36 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  24.47 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.64 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1674  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.14 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.44 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.05 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.15 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.79 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.24 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.59 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.8 
 
 
411 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.29 
 
 
424 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.8 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.29 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2822  dihydroorotate dehydrogenase 1  25.46 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0209539  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.8 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.8 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  25.24 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.8 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  24.17 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.19 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  25 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.27 
 
 
300 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.08 
 
 
439 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.06 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.11 
 
 
301 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.12 
 
 
422 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.88 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  19.94 
 
 
437 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.6 
 
 
434 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.15 
 
 
437 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.26 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.23 
 
 
436 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1663  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.04 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000377649  hitchhiker  0.00130858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  20.81 
 
 
437 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.69 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.67 
 
 
441 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>