More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0051 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  100 
 
 
330 aa  671    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  83.97 
 
 
321 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2822  dihydroorotate dehydrogenase 1  76.6 
 
 
331 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0209539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  62.84 
 
 
297 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3426  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  58.88 
 
 
312 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  47.68 
 
 
313 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.34 
 
 
313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  47.21 
 
 
305 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  47.88 
 
 
304 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  47.87 
 
 
304 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.21 
 
 
311 aa  281  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.58 
 
 
304 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.43 
 
 
305 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.25 
 
 
305 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.75 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.03 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  49.51 
 
 
314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.23 
 
 
305 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0163  dihydroorotate dehydrogenase 1B  44.22 
 
 
311 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000375439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.03 
 
 
309 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.03 
 
 
309 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.7 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.7 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.7 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.7 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.7 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.7 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.7 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.03 
 
 
309 aa  269  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1065  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.66 
 
 
307 aa  268  8.999999999999999e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.257669 
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.6 
 
 
310 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  42.95 
 
 
307 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.85 
 
 
322 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  47.21 
 
 
352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  43.09 
 
 
300 aa  266  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.92 
 
 
324 aa  265  7e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1244  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.03 
 
 
310 aa  265  8e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  45.92 
 
 
417 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  44.19 
 
 
303 aa  263  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0657  dihydroorotate dehydrogenase family protein  43.29 
 
 
300 aa  264  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.345915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0947  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  43.63 
 
 
307 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1755  dihydroorotate dehydrogenase 1B  47.08 
 
 
305 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1814  dihydroorotate dehydrogenase 1B  43.93 
 
 
302 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00465279  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0969  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.78 
 
 
315 aa  260  3e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  44.52 
 
 
300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1663  dihydroorotate dehydrogenase family protein  43.65 
 
 
356 aa  257  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000377649  hitchhiker  0.00130858 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1300  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.87 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1382  dihydroorotate dehydrogenase 1B  42.09 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0126255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1197  dihydroorotate dehydrogenase 1B  42.09 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0785  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.95 
 
 
299 aa  251  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1279  hypothetical protein  45.85 
 
 
302 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1495  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.69 
 
 
303 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  42.67 
 
 
321 aa  249  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  43.52 
 
 
314 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11880  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  43.42 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.0175843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09420  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  43.38 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2846  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.1 
 
 
302 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2200  dihydroorotate dehydrogenase family protein  44 
 
 
308 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2402  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40.79 
 
 
303 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.350257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2143  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
308 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  41.58 
 
 
308 aa  235  8e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2850  dihydroorotate dehydrogenase family protein  44.74 
 
 
302 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0056  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  43.67 
 
 
308 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1596  dihydroorotate dehydrogenase 1  42.76 
 
 
331 aa  229  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0553  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.41 
 
 
309 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0072  dihydroorotate dehydrogenase family protein  44.04 
 
 
307 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0019  dihydroorotate dehydrogenase family protein  42.81 
 
 
304 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07830  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  42.72 
 
 
305 aa  224  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.221427  normal  0.399938 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1783  dihydroorotate dehydrogenase 1  41.14 
 
 
313 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.56 
 
 
311 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0721  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40.4 
 
 
307 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2810  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40.2 
 
 
324 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0375  dihydroorotate dehydrogenase family protein  43.83 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3010  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.55 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0061654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0614  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40.07 
 
 
314 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5904  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40.8 
 
 
325 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5681  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.1 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00753595  normal  0.0457266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1059  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  42.35 
 
 
330 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0593  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  39.39 
 
 
314 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0729  dihydroorotate dehydrogenase family protein  37.13 
 
 
303 aa  209  6e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000867503 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0811  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.52 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0183468  normal  0.536442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1769  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.61 
 
 
311 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1296  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  40.48 
 
 
351 aa  199  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.717011  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0529  dihydroorotate dehydrogenase  38.38 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0772  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40.33 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1572  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35.83 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0950593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1357  dihydroorotate dehydrogenase family protein  43.12 
 
 
313 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.736204  normal  0.101187 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  37.58 
 
 
299 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  37.06 
 
 
320 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0923  dihydroorotate dehydrogenase 1B  42.8 
 
 
333 aa  187  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1089  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.54 
 
 
316 aa  182  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00844551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1475  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  41.42 
 
 
304 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.96 
 
 
304 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.03 
 
 
303 aa  170  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3206  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.16 
 
 
303 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454845  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.88 
 
 
305 aa  169  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.63 
 
 
304 aa  168  9e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.9 
 
 
304 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.95 
 
 
304 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.23 
 
 
301 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>