192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1262 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1262  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
343 aa  706    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0190  dihydroorotate dehydrogenase 2  70.24 
 
 
339 aa  507  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0185  dihydroorotate dehydrogenase 2  70.24 
 
 
339 aa  507  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.373887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3045  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.67 
 
 
343 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.675973  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4370  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.05 
 
 
347 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.88 
 
 
330 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.88 
 
 
330 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2385  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.88 
 
 
340 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0729  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.67 
 
 
334 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2635  dihydroorotate dehydrogenase  50.6 
 
 
355 aa  355  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.39 
 
 
333 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4110  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.71 
 
 
336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000291648  normal  0.122878 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2467  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.83 
 
 
336 aa  309  5e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7745  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2839  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.55 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4864  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.71 
 
 
340 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4953  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.71 
 
 
340 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5232  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.79 
 
 
340 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.768004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0606  dihydroorotate dehydrogenase  43.33 
 
 
332 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0808  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 
328 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335542  normal  0.0281736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0762  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.93 
 
 
328 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0809  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.93 
 
 
328 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0801526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0813  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.93 
 
 
328 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.362668  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2988  dihydroorotate dehydrogenase  43.24 
 
 
337 aa  269  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16810  Dihydroorotate dehydrogenase  41.19 
 
 
332 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2219  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.46 
 
 
328 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32415  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000361805  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2084  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.23 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2445  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.91 
 
 
375 aa  226  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2055  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.37 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.100405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.65 
 
 
381 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  32.69 
 
 
390 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.41 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.1 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.53 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.94 
 
 
432 aa  84  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.15 
 
 
461 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.61 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.61 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.89 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.61 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  25 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.61 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.61 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.16 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.2 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.15 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3443  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.04 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.28 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.67 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.12 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.9 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.13 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.67 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.12 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.12 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.19 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  23.12 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.12 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.12 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.12 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.9 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.9 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.9 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.9 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.9 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.1 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.36 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.9 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.77 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.9 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.82 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.77 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.15 
 
 
424 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.81 
 
 
411 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.46 
 
 
437 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.47 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.46 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.8 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.47 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.8 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.43 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.89 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.64 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.09 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.15 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.15 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.11 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.06 
 
 
436 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  22.49 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.67 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3426  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  25.56 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.84 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.55 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  26.32 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.18 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.07 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.43 
 
 
305 aa  67  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.24 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  24.35 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.88 
 
 
437 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>