175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0768 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
333 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4110  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.23 
 
 
336 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000291648  normal  0.122878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3045  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.67 
 
 
343 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.675973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4864  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.31 
 
 
340 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4953  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.31 
 
 
340 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358997  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1262  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.39 
 
 
343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5232  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.31 
 
 
340 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.768004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2988  dihydroorotate dehydrogenase  53.85 
 
 
337 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0729  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.17 
 
 
334 aa  329  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0190  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.46 
 
 
339 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.24 
 
 
330 aa  329  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0185  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.46 
 
 
339 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.373887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.54 
 
 
330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2635  dihydroorotate dehydrogenase  48.49 
 
 
355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4370  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.31 
 
 
347 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2385  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 
340 aa  301  9e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0808  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.9 
 
 
328 aa  301  9e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335542  normal  0.0281736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16810  Dihydroorotate dehydrogenase  47.45 
 
 
332 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0606  dihydroorotate dehydrogenase  45.15 
 
 
332 aa  295  8e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0762  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.98 
 
 
328 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0809  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.59 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0801526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0813  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 
328 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.362668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2467  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.98 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7745  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2839  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.42 
 
 
336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2219  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.61 
 
 
328 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32415  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2084  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 
328 aa  241  9e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2445  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.55 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.44 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000361805  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2055  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.47 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.100405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.44 
 
 
381 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  30.67 
 
 
390 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.47 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.01 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.48 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.98 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.98 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.98 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.98 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.99 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.7 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.17 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.7 
 
 
434 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.7 
 
 
434 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  20.75 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.76 
 
 
424 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.29 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.76 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.34 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.91 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.44 
 
 
461 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  25.7 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.23 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.91 
 
 
411 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  21.91 
 
 
411 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.29 
 
 
422 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.91 
 
 
411 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.92 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  21.91 
 
 
411 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.91 
 
 
411 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.46 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.15 
 
 
424 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.39 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.23 
 
 
425 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.6 
 
 
411 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.28 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.97 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.68 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.92 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.92 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.92 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.92 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.92 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.92 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.92 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.85 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.88 
 
 
432 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.23 
 
 
424 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.24 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.92 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.15 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.34 
 
 
411 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.15 
 
 
309 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.42 
 
 
436 aa  62.8  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.72 
 
 
300 aa  62.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  24.62 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0657  dihydroorotate dehydrogenase family protein  22.41 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.345915  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.79 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.12 
 
 
441 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.27 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0163  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.26 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000375439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1572  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.21 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0950593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.29 
 
 
304 aa  59.3  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.09 
 
 
436 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.12 
 
 
437 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.48 
 
 
435 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.85 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3426  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  23.04 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  22.93 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.78 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>