162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4110 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4110  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
336 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000291648  normal  0.122878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4864  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.26 
 
 
340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4953  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.26 
 
 
340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5232  dihydroorotate dehydrogenase 2  67.37 
 
 
340 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.768004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.23 
 
 
333 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3045  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 
343 aa  318  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.675973  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1262  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.71 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0729  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 
334 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0190  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.24 
 
 
339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0185  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.24 
 
 
339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.373887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4370  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.39 
 
 
347 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.53 
 
 
330 aa  299  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.3 
 
 
330 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2988  dihydroorotate dehydrogenase  50.76 
 
 
337 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2635  dihydroorotate dehydrogenase  44.35 
 
 
355 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16810  Dihydroorotate dehydrogenase  45.73 
 
 
332 aa  271  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0808  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.82 
 
 
328 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335542  normal  0.0281736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0809  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.12 
 
 
328 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0801526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0813  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.82 
 
 
328 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.362668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0762  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 
328 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2385  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.2 
 
 
340 aa  258  7e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2467  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.46 
 
 
336 aa  255  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7745  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0606  dihydroorotate dehydrogenase  43.56 
 
 
332 aa  249  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2084  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.36 
 
 
328 aa  248  8e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2839  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.81 
 
 
336 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2219  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.68 
 
 
328 aa  233  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32415  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2445  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.38 
 
 
375 aa  209  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.59 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000361805  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2055  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.44 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.100405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.58 
 
 
381 aa  165  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  31.76 
 
 
390 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.96 
 
 
299 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.35 
 
 
398 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.69 
 
 
432 aa  72.4  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  23.15 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.99 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.7 
 
 
422 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.26 
 
 
411 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.88 
 
 
411 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.88 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  21.88 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  21.88 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.88 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.88 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.88 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5681  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.38 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00753595  normal  0.0457266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  21 
 
 
411 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.58 
 
 
411 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  21 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  21 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  21 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  21 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.37 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.31 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.09 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.1 
 
 
436 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.1 
 
 
437 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.1 
 
 
437 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.1 
 
 
437 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.1 
 
 
435 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.1 
 
 
435 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.1 
 
 
435 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.95 
 
 
441 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.1 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.58 
 
 
437 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5904  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.73 
 
 
325 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.36 
 
 
461 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0072  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.41 
 
 
307 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.38 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2143  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.55 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.71 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.16 
 
 
439 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1161  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.62 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.109193  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.08 
 
 
444 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.88 
 
 
444 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.16 
 
 
436 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.36 
 
 
300 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.05 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.73 
 
 
429 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.36 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.36 
 
 
437 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.25 
 
 
304 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  21.45 
 
 
304 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  22.36 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.36 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1644  dihydroorotate dehydrogenase 1A  24.15 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.46 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.42 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.42 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.42 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.42 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.42 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.42 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.42 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.42 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0507  dihydroorotate dehydrogenase 1A  26.8 
 
 
310 aa  53.5  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000369994  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  27.73 
 
 
434 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  21.78 
 
 
304 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>