177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0762 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0762  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
328 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0813  dihydroorotate dehydrogenase 2  96.04 
 
 
328 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.362668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0809  dihydroorotate dehydrogenase 2  95.73 
 
 
328 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0801526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0808  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.22 
 
 
328 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335542  normal  0.0281736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3045  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.17 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.675973  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.98 
 
 
333 aa  292  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0293555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1262  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.93 
 
 
343 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2064  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.72 
 
 
330 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.7981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0190  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.55 
 
 
339 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0185  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.55 
 
 
339 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.373887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4370  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.31 
 
 
347 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0729  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.58 
 
 
334 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4864  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.73 
 
 
340 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4953  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.73 
 
 
340 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358997  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2635  dihydroorotate dehydrogenase  42.51 
 
 
355 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4110  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000291648  normal  0.122878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16810  Dihydroorotate dehydrogenase  44.51 
 
 
332 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2385  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 
340 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2467  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.81 
 
 
336 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7745  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5232  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 
340 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.768004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2988  dihydroorotate dehydrogenase  43.9 
 
 
337 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2084  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.05 
 
 
328 aa  246  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2219  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.96 
 
 
328 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32415  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2839  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.92 
 
 
336 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0606  dihydroorotate dehydrogenase  39.21 
 
 
332 aa  235  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2445  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.69 
 
 
375 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.96 
 
 
328 aa  229  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000361805  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2055  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.76 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.100405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.13 
 
 
381 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  29.78 
 
 
390 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.24 
 
 
363 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.75 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.79 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.69 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2361  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.57 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  25.47 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.27 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  23.57 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.94 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.28 
 
 
437 aa  69.3  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  21.78 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.94 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.78 
 
 
434 aa  69.3  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.42 
 
 
435 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.94 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.94 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.92 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  23.94 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.94 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.08 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.94 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.55 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.62 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.71 
 
 
437 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.64 
 
 
411 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.82 
 
 
437 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.82 
 
 
437 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.82 
 
 
437 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.82 
 
 
435 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.82 
 
 
435 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  24.5 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.82 
 
 
436 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  21.73 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.3 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0296  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.42 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.42 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  22.51 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.95 
 
 
444 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.62 
 
 
422 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0657  dihydroorotate dehydrogenase family protein  22.5 
 
 
300 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.345915  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  23.36 
 
 
300 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.47 
 
 
435 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.33 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.12 
 
 
436 aa  63.5  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1161  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.1 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.109193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.18 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.33 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.6 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.52 
 
 
438 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.92 
 
 
434 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  24.37 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.92 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3449  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.05 
 
 
437 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591903  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  22.61 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.39 
 
 
444 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.76 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2712  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.26 
 
 
434 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462922  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.95 
 
 
425 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.74 
 
 
441 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  23.95 
 
 
424 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1065  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.16 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.257669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  22.29 
 
 
437 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.86 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.31 
 
 
304 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>