More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4151 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  69.04 
 
 		 436 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  78.94 
 
 		 439 aa  720    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  70.18 
 
 		 436 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  69.11 
 
 		 437 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0296  dihydropyrimidine dehydrogenase  69.95 
 
 		 436 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0967  dihydropyrimidine dehydrogenase  82.64 
 
 		 442 aa  724    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2361  dihydropyrimidine dehydrogenase  69.79 
 
 		 437 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  72.98 
 
 		 435 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  69.57 
 
 		 437 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  75.17 
 
 		 437 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3449  dihydropyrimidine dehydrogenase  69.11 
 
 		 437 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591903  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4151  dihydropyrimidine dehydrogenase  100 
 
 		 436 aa  900    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  68.65 
 
 		 437 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1363  dihydropyrimidine dehydrogenase  68.66 
 
 		 432 aa  623  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.709069 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.51 
 
 		 434 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.73 
 
 		 434 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2712  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.73 
 
 		 434 aa  612  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462922  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.05 
 
 		 434 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.21 
 
 		 434 aa  607  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.2 
 
 		 441 aa  601  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.13 
 
 		 437 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.59 
 
 		 435 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  65.9 
 
 		 444 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.82 
 
 		 435 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.59 
 
 		 435 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  65.67 
 
 		 444 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.2 
 
 		 437 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  65.67 
 
 		 436 aa  581  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.2 
 
 		 437 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.36 
 
 		 438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.43 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  63.74 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.43 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  63.74 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.2 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  63.97 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  62.5 
 
 		 426 aa  545  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3443  dihydropyrimidine dehydrogenase  62.3 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  54.61 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  55.61 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  51.4 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1889  dihydroorotate dehydrogenase family protein  49.88 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0110983  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.05 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  40 
 
 		 411 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  40 
 
 		 411 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  40 
 
 		 411 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  40 
 
 		 411 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.24 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.27 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  39.27 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.27 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.27 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  39.27 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.27 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.27 
 
 		 411 aa  300  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.51 
 
 		 411 aa  299  7e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.02 
 
 		 411 aa  298  9e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  37.4 
 
 		 398 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.68 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.39 
 
 		 363 aa  133  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.78 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.08 
 
 		 307 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.42 
 
 		 299 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.57 
 
 		 301 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.83 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.97 
 
 		 300 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.29 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1663  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.66 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000377649  hitchhiker  0.00130858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  35.11 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0785  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.7 
 
 		 299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  25.69 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0163  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.14 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000375439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  30.06 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.82 
 
 		 314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.97 
 
 		 304 aa  111  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.97 
 
 		 305 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.57 
 
 		 304 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09420  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.29 
 
 		 304 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.71 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.5 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.88 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.27 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.3 
 
 		 311 aa  107  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.19 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.67 
 
 		 303 aa  106  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0947  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  37.06 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.26 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1814  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.17 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00465279  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.13 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  30.73 
 
 		 321 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.93 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2200  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.07 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  33.07 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.51 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.35 
 
 		 310 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.86 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.64 
 
 		 304 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11880  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.57 
 
 		 306 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.0175843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.39 
 
 		 305 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  31.62 
 
 		 321 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>