More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2200 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2200  dihydroorotate dehydrogenase family protein  100 
 
 
308 aa  624  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0072  dihydroorotate dehydrogenase family protein  70.59 
 
 
307 aa  434  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0056  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  67.43 
 
 
308 aa  421  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2143  dihydroorotate dehydrogenase family protein  67.43 
 
 
308 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0019  dihydroorotate dehydrogenase family protein  63.84 
 
 
304 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2846  dihydroorotate dehydrogenase family protein  62.54 
 
 
302 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  56.86 
 
 
305 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  56.86 
 
 
305 aa  348  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  56.39 
 
 
304 aa  346  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  57.24 
 
 
305 aa  345  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  58.92 
 
 
304 aa  345  6e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  55.37 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1495  dihydroorotate dehydrogenase family protein  55.74 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  56.39 
 
 
352 aa  335  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  55.23 
 
 
305 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  56.36 
 
 
304 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  53.8 
 
 
305 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1814  dihydroorotate dehydrogenase 1B  52.6 
 
 
302 aa  322  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00465279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1755  dihydroorotate dehydrogenase 1B  55.88 
 
 
305 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  51.31 
 
 
321 aa  311  9e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  50.16 
 
 
300 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  51.19 
 
 
314 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09420  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  50.99 
 
 
304 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1065  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.15 
 
 
307 aa  295  8e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.257669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2850  dihydroorotate dehydrogenase family protein  52.45 
 
 
302 aa  292  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.83 
 
 
313 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.17 
 
 
313 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  48.38 
 
 
307 aa  289  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  46.58 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0947  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  50.97 
 
 
307 aa  285  9e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  48.99 
 
 
322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.31 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.31 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.5 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.31 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.97 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  46.69 
 
 
303 aa  282  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.97 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.97 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.97 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.97 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.97 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.97 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1279  hypothetical protein  49.17 
 
 
302 aa  281  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0721  dihydroorotate dehydrogenase family protein  48.14 
 
 
307 aa  281  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1300  dihydroorotate dehydrogenase family protein  53.26 
 
 
307 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  50.34 
 
 
324 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0593  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  49.32 
 
 
314 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0163  dihydroorotate dehydrogenase 1B  47.44 
 
 
311 aa  279  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000375439  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1244  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.97 
 
 
310 aa  278  6e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.62 
 
 
309 aa  278  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1783  dihydroorotate dehydrogenase 1  48.14 
 
 
313 aa  276  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0614  dihydroorotate dehydrogenase family protein  50 
 
 
314 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1663  dihydroorotate dehydrogenase family protein  49.35 
 
 
356 aa  276  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000377649  hitchhiker  0.00130858 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1197  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.72 
 
 
299 aa  275  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.66 
 
 
308 aa  275  7e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1596  dihydroorotate dehydrogenase 1  47.95 
 
 
331 aa  275  7e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  49.66 
 
 
417 aa  275  7e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1382  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.72 
 
 
299 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0126255  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.66 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11880  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  47.39 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.0175843 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0553  dihydroorotate dehydrogenase family protein  47.62 
 
 
309 aa  273  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0729  dihydroorotate dehydrogenase family protein  46.28 
 
 
303 aa  267  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000867503 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0657  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
300 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.345915  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0772  dihydroorotate dehydrogenase family protein  50.98 
 
 
333 aa  266  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0969  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.34 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0785  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.83 
 
 
299 aa  263  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3426  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  47.81 
 
 
312 aa  262  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2402  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.52 
 
 
303 aa  249  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.350257  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  44.63 
 
 
311 aa  248  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0375  dihydroorotate dehydrogenase family protein  48.12 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2810  dihydroorotate dehydrogenase family protein  42.81 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5681  dihydroorotate dehydrogenase family protein  46.91 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00753595  normal  0.0457266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1769  dihydroorotate dehydrogenase family protein  42.3 
 
 
311 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.49 
 
 
297 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07830  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  47.71 
 
 
305 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.221427  normal  0.399938 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5904  dihydroorotate dehydrogenase family protein  46.25 
 
 
325 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  44 
 
 
330 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3010  dihydroorotate dehydrogenase family protein  44.41 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0061654  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2822  dihydroorotate dehydrogenase 1  43.81 
 
 
331 aa  231  9e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0209539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  43.42 
 
 
320 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1572  dihydroorotate dehydrogenase family protein  42.12 
 
 
306 aa  229  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0950593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  43 
 
 
321 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1296  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  46.36 
 
 
351 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.717011  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1357  dihydroorotate dehydrogenase family protein  46.27 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.736204  normal  0.101187 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0529  dihydroorotate dehydrogenase  43.4 
 
 
323 aa  217  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0811  dihydroorotate dehydrogenase family protein  39.87 
 
 
308 aa  211  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0183468  normal  0.536442 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  41.61 
 
 
304 aa  209  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1059  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  42.3 
 
 
330 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  39.67 
 
 
300 aa  199  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0923  dihydroorotate dehydrogenase 1B  41.43 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  37.97 
 
 
299 aa  193  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3100  dihydroorotate dehydrogenase family protein  39.22 
 
 
316 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  39.12 
 
 
301 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.95 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1863  dihydroorotate dehydrogenase family protein  46.77 
 
 
319 aa  182  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.99 
 
 
304 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.96 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.99 
 
 
304 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.13 
 
 
303 aa  175  9e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>