More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1644 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1644  dihydroorotate dehydrogenase 1A  100 
 
 
311 aa  635    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1173  dihydroorotate dehydrogenase 1A  66.45 
 
 
312 aa  420  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000817907  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0507  dihydroorotate dehydrogenase 1A  60.32 
 
 
310 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000369994  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0264  dihydroorotate dehydrogenase 1A  57.28 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0328466  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1279  dihydroorotate dehydrogenase 1A  57.23 
 
 
312 aa  350  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.066651  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48112  predicted protein  41.74 
 
 
387 aa  220  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.230044  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.13 
 
 
299 aa  156  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.67 
 
 
304 aa  142  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.11 
 
 
305 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2810  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.45 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.33 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5681  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.99 
 
 
325 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00753595  normal  0.0457266 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5904  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.99 
 
 
325 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.67 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.65 
 
 
304 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.36 
 
 
300 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.29 
 
 
305 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.1 
 
 
305 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3010  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.94 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0061654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3206  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.97 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454845  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.65 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.87 
 
 
300 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0729  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.39 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000867503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.3 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1769  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.09 
 
 
311 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1244  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.08 
 
 
310 aa  117  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.77 
 
 
304 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.79 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.19 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1296  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  31.51 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.717011  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.67 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0163  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.42 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000375439  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.45 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.45 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.03 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_002950  PG1065  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.87 
 
 
307 aa  114  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.257669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1495  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.88 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1572  dihydroorotate dehydrogenase family protein  33.1 
 
 
306 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0950593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  28.39 
 
 
314 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.43 
 
 
305 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0614  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.18 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.23 
 
 
304 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.57 
 
 
303 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0529  dihydroorotate dehydrogenase  29.9 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2143  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.03 
 
 
308 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  29.75 
 
 
321 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.98 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.24 
 
 
330 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.77 
 
 
324 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1279  hypothetical protein  30.19 
 
 
302 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2402  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.66 
 
 
303 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.350257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.55 
 
 
305 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.55 
 
 
301 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.62 
 
 
297 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11880  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  28.9 
 
 
306 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.0175843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.98 
 
 
309 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.74 
 
 
304 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  28.89 
 
 
352 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1475  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  31.43 
 
 
304 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  29.04 
 
 
417 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.7 
 
 
309 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.66 
 
 
309 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.66 
 
 
309 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.66 
 
 
309 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.66 
 
 
309 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09420  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  31.43 
 
 
304 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.66 
 
 
309 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.66 
 
 
309 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.66 
 
 
309 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0721  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.67 
 
 
307 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0657  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.29 
 
 
300 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.345915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1596  dihydroorotate dehydrogenase 1  30.2 
 
 
331 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0969  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.57 
 
 
315 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  28.34 
 
 
303 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2822  dihydroorotate dehydrogenase 1  29.35 
 
 
331 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0209539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1814  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.32 
 
 
302 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00465279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0947  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  28.62 
 
 
307 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.23 
 
 
313 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.03 
 
 
309 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0056  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  29.3 
 
 
308 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.25 
 
 
310 aa  102  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.92 
 
 
313 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0772  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.94 
 
 
333 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0019  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.52 
 
 
304 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1300  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.2 
 
 
307 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1755  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.32 
 
 
305 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.82 
 
 
322 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2200  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.94 
 
 
308 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  28.57 
 
 
321 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1783  dihydroorotate dehydrogenase 1  29.04 
 
 
313 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2850  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.73 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.1 
 
 
314 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3426  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  30.69 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1185  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  29.1 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0072  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.01 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0553  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.9 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1382  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.39 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0126255  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1742  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.93 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1197  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.97 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0811  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.88 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0183468  normal  0.536442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>