More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1185 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1185  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  630  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5282  dihydroorotate oxidase  68.09 
 
 
321 aa  355  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12731  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48112  predicted protein  33.33 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.230044  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.29 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1644  dihydroorotate dehydrogenase 1A  29.43 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.22 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1279  dihydroorotate dehydrogenase 1A  29.02 
 
 
312 aa  113  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.066651  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1572  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.66 
 
 
306 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0950593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  29.45 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0507  dihydroorotate dehydrogenase 1A  29.63 
 
 
310 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000369994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1173  dihydroorotate dehydrogenase 1A  29 
 
 
312 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000817907  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0657  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.27 
 
 
300 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.345915  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1065  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.82 
 
 
307 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.257669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2822  dihydroorotate dehydrogenase 1  29.3 
 
 
331 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0209539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.58 
 
 
305 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.77 
 
 
322 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  25.9 
 
 
305 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.76 
 
 
304 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2143  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.38 
 
 
308 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.58 
 
 
305 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.29 
 
 
300 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.62 
 
 
304 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0264  dihydroorotate dehydrogenase 1A  28.95 
 
 
312 aa  102  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0328466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.82 
 
 
313 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0072  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.9 
 
 
307 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0019  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.16 
 
 
304 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.32 
 
 
305 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  31.36 
 
 
352 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09420  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  27.56 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1814  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.87 
 
 
302 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00465279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0729  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.45 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000867503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.34 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.62 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0056  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  29.35 
 
 
308 aa  99  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.99 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.24 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3206  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.68 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454845  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1596  dihydroorotate dehydrogenase 1  30.56 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0163  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.48 
 
 
311 aa  97.1  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000375439  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.3 
 
 
304 aa  96.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1382  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.22 
 
 
299 aa  95.9  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0126255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.52 
 
 
309 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.87 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.01 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.85 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.76 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0529  dihydroorotate dehydrogenase  26.8 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1197  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.22 
 
 
299 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.85 
 
 
309 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.47 
 
 
330 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.39 
 
 
304 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0593  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  26.96 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3010  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.36 
 
 
336 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0061654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2810  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.71 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  30.06 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.52 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.52 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.52 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.52 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.52 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.52 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.52 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  27.3 
 
 
417 aa  92.4  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.66 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  26.74 
 
 
303 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1783  dihydroorotate dehydrogenase 1  26.83 
 
 
313 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1300  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.52 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.86 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0785  dihydroorotate dehydrogenase family protein  26.44 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  26.3 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1755  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.71 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  24.76 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2200  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.86 
 
 
308 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.56 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1475  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.79 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.33 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.52 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0969  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.37 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3426  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  28.33 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.22 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  27.43 
 
 
311 aa  89  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1296  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  31.08 
 
 
351 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.717011  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  29.59 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.53 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0375  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.28 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.42 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0553  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.78 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0614  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.95 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5681  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.62 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00753595  normal  0.0457266 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1279  hypothetical protein  27.34 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0721  dihydroorotate dehydrogenase family protein  25.52 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2402  dihydroorotate dehydrogenase family protein  23.61 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.350257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0947  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  26.25 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302447  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0772  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.66 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5904  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.38 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.91 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1663  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.33 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000377649  hitchhiker  0.00130858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1495  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.25 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2846  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.33 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11880  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  28.57 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.0175843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>