More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2846 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2846  dihydroorotate dehydrogenase family protein  100 
 
 
302 aa  607  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2143  dihydroorotate dehydrogenase family protein  69.7 
 
 
308 aa  417  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0072  dihydroorotate dehydrogenase family protein  69.28 
 
 
307 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0056  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  67.43 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0019  dihydroorotate dehydrogenase family protein  68.98 
 
 
304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2200  dihydroorotate dehydrogenase family protein  62.54 
 
 
308 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  57.81 
 
 
304 aa  335  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  56.62 
 
 
305 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2150  dihydroorotate dehydrogenase 1B  57.33 
 
 
305 aa  329  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000128716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  55.96 
 
 
305 aa  328  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2304  dihydroorotate dehydrogenase 1B  56.57 
 
 
304 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1495  dihydroorotate dehydrogenase family protein  55.48 
 
 
303 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  54.3 
 
 
314 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  54.46 
 
 
352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  53.64 
 
 
305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1755  dihydroorotate dehydrogenase 1B  55.78 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  57.35 
 
 
304 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2350  dihydroorotate dehydrogenase 1B  52.94 
 
 
305 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.893945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  50.17 
 
 
314 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  51.52 
 
 
309 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09420  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  52.67 
 
 
304 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  50 
 
 
321 aa  288  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1814  dihydroorotate dehydrogenase 1B  47.85 
 
 
302 aa  288  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00465279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3933  dihydroorotate dehydrogenase 1B  51.18 
 
 
309 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  51.18 
 
 
309 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3735  dihydroorotate dehydrogenase 1B  51.18 
 
 
309 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.329166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3626  dihydroorotate dehydrogenase 1B  51.18 
 
 
309 aa  287  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3643  dihydroorotate dehydrogenase 1B  51.18 
 
 
309 aa  287  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4023  dihydroorotate dehydrogenase 1B  51.18 
 
 
309 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3898  dihydroorotate dehydrogenase 1B  51.18 
 
 
309 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211547 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1279  hypothetical protein  52.17 
 
 
302 aa  286  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  50.51 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1259  dihydroorotate dehydrogenase 1B  50.84 
 
 
309 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3982  dihydroorotate dehydrogenase 1B  50.84 
 
 
309 aa  285  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  46.2 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  51.21 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2850  dihydroorotate dehydrogenase family protein  54.23 
 
 
302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  51.18 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  47.85 
 
 
307 aa  281  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  50 
 
 
310 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.34 
 
 
300 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  49.33 
 
 
417 aa  278  9e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0947  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  53 
 
 
307 aa  276  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3426  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  48.37 
 
 
312 aa  275  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  48.32 
 
 
324 aa  275  8e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  50.34 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1065  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.32 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.257669 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1244  dihydroorotate dehydrogenase 1B  49.65 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11880  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  47.68 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.0175843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1197  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.42 
 
 
299 aa  268  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1382  dihydroorotate dehydrogenase 1B  46.08 
 
 
299 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0126255  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0785  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.18 
 
 
299 aa  264  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1300  dihydroorotate dehydrogenase family protein  54.1 
 
 
307 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  50.92 
 
 
322 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1663  dihydroorotate dehydrogenase family protein  49.5 
 
 
356 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000377649  hitchhiker  0.00130858 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  45.27 
 
 
308 aa  260  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0657  dihydroorotate dehydrogenase family protein  44.19 
 
 
300 aa  260  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.345915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  45.64 
 
 
303 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1783  dihydroorotate dehydrogenase 1  45.92 
 
 
313 aa  255  8e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0163  dihydroorotate dehydrogenase 1B  47.46 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000375439  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0721  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.24 
 
 
307 aa  253  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0593  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  49.62 
 
 
314 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1596  dihydroorotate dehydrogenase 1  44.18 
 
 
331 aa  250  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0614  dihydroorotate dehydrogenase family protein  48.48 
 
 
314 aa  248  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0553  dihydroorotate dehydrogenase family protein  44.9 
 
 
309 aa  247  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0300599  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0729  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.55 
 
 
303 aa  247  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000867503 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0969  dihydroorotate dehydrogenase 1B  43.93 
 
 
315 aa  246  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0375  dihydroorotate dehydrogenase family protein  50.5 
 
 
308 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2402  dihydroorotate dehydrogenase family protein  46.15 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.350257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0051  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.1 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0772  dihydroorotate dehydrogenase family protein  49.84 
 
 
333 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07830  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  45.36 
 
 
305 aa  236  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.221427  normal  0.399938 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  44.82 
 
 
311 aa  236  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2822  dihydroorotate dehydrogenase 1  43.79 
 
 
331 aa  235  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0209539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3011  dihydroorotate dehydrogenase family protein  43.62 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  46.18 
 
 
297 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1296  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  49.48 
 
 
351 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.717011  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3010  dihydroorotate dehydrogenase family protein  45.23 
 
 
336 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0061654  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  43.14 
 
 
321 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5904  dihydroorotate dehydrogenase family protein  43.71 
 
 
325 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5681  dihydroorotate dehydrogenase family protein  43.71 
 
 
325 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00753595  normal  0.0457266 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0529  dihydroorotate dehydrogenase  44.21 
 
 
323 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1769  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.86 
 
 
311 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1572  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40.57 
 
 
306 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0950593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2810  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.86 
 
 
324 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0811  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.91 
 
 
308 aa  210  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0183468  normal  0.536442 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0923  dihydroorotate dehydrogenase 1B  43.21 
 
 
333 aa  203  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1059  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  43.11 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1357  dihydroorotate dehydrogenase family protein  44.53 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.736204  normal  0.101187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3100  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.53 
 
 
316 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.21 
 
 
299 aa  192  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  39.08 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.28 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  39.39 
 
 
304 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.03 
 
 
304 aa  182  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.73 
 
 
304 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.7 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1475  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  43.71 
 
 
304 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.32 
 
 
304 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3206  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40 
 
 
303 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454845  normal  0.81979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>