220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4359 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4359  hydantoinase B/oxoprolinase  100 
 
 
758 aa  1586    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1448  acetone carboxylase alpha subunit  50.2 
 
 
768 aa  775    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.674033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1207  hydantoinase B/oxoprolinase  50.67 
 
 
748 aa  782    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215827  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2242  hydantoinase B/oxoprolinase  55.98 
 
 
743 aa  865    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2506  hydantoinase B/oxoprolinase  50.2 
 
 
774 aa  783    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.615482  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11380  acetophenone carboxylase  83.25 
 
 
758 aa  1350    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1342  hydantoinase B/oxoprolinase  84.96 
 
 
772 aa  1361    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4899  hydantoinase B/oxoprolinase  49.28 
 
 
770 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.313887  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1152  hydantoinase B/oxoprolinase  54.58 
 
 
747 aa  852    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1162  hydantoinase B/oxoprolinase  84.04 
 
 
758 aa  1367    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1834  hydantoinase B/oxoprolinase  43.99 
 
 
752 aa  706    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1847  hydantoinase B/oxoprolinase  31.4 
 
 
686 aa  303  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  26.17 
 
 
600 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6173  acetone carboxylase, alpha subunit  25.6 
 
 
774 aa  170  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.84 
 
 
775 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1777  hydantoinase B/oxoprolinase  24.53 
 
 
737 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2092  hydantoinase B/oxoprolinase  24.69 
 
 
736 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3470  Hydantoinase B/oxoprolinase  24.22 
 
 
774 aa  162  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3604  hydantoinase B/oxoprolinase  23.59 
 
 
775 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918377  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3716  hydantoinase B/oxoprolinase  24.76 
 
 
730 aa  160  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.207387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3510  hydantoinase B/oxoprolinase  25.23 
 
 
776 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0356093  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1030  acetone carboxylase, alpha subunit  25.15 
 
 
779 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127431  normal  0.789221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4106  acetone carboxylase subunit alpha (or Hydantoinase B/oxoprolinase)  24.59 
 
 
774 aa  158  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1019  acetone carboxylase, alpha subunit  24.89 
 
 
774 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5522  Hydantoinase B/oxoprolinase  24.12 
 
 
776 aa  153  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93174  normal  0.130662 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.96 
 
 
708 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.96 
 
 
708 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0942  hydantoinase B/oxoprolinase  23.46 
 
 
774 aa  150  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.4 
 
 
657 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4262  hydantoinase B/oxoprolinase  23.41 
 
 
771 aa  147  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25 
 
 
646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.75 
 
 
564 aa  139  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.5 
 
 
585 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20920  acetone carboxylase alpha subunit; AcxB  24.27 
 
 
770 aa  136  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.608945  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6151  hydantoinase B/oxoprolinase  24.17 
 
 
774 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459932 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.99 
 
 
583 aa  134  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.23 
 
 
580 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.9 
 
 
681 aa  132  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.51 
 
 
562 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.88 
 
 
586 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  26.87 
 
 
565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.98 
 
 
577 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  27.06 
 
 
845 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.96 
 
 
564 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.75 
 
 
660 aa  111  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.08 
 
 
587 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.39 
 
 
579 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  23.41 
 
 
647 aa  109  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.35 
 
 
577 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  23.24 
 
 
640 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  22.74 
 
 
566 aa  108  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4825  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.67 
 
 
586 aa  107  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.308896  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.96 
 
 
556 aa  107  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.5 
 
 
519 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.86 
 
 
529 aa  106  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.83 
 
 
624 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.87 
 
 
521 aa  104  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.89 
 
 
597 aa  104  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  23.1 
 
 
613 aa  104  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  23.27 
 
 
647 aa  103  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  23.4 
 
 
671 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.54 
 
 
539 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.57 
 
 
634 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.54 
 
 
575 aa  102  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.4 
 
 
577 aa  102  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.84 
 
 
561 aa  100  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  22.75 
 
 
563 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.24 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  22.61 
 
 
578 aa  99  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2132  Hydantoinase B/oxoprolinase  21.68 
 
 
626 aa  98.2  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.35 
 
 
541 aa  97.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.04 
 
 
1206 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  24.87 
 
 
574 aa  95.5  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3812  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.92 
 
 
568 aa  95.1  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135188  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.34 
 
 
561 aa  93.6  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  22.53 
 
 
548 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  23.24 
 
 
611 aa  92.8  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.52 
 
 
531 aa  92.8  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1497  hydantoinase B/oxoprolinase  23.59 
 
 
659 aa  92.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00877273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  22.08 
 
 
551 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  27.36 
 
 
577 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.99 
 
 
584 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.47 
 
 
515 aa  90.9  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.98 
 
 
552 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0999  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.46 
 
 
1228 aa  90.5  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.74 
 
 
582 aa  90.5  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.36 
 
 
633 aa  90.1  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.36 
 
 
548 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  24.06 
 
 
581 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2528  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.46 
 
 
629 aa  88.6  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165308  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  27.14 
 
 
537 aa  87.8  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.76 
 
 
589 aa  87.4  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.71 
 
 
645 aa  87.8  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.71 
 
 
514 aa  87.4  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0136  Hydantoinase B/oxoprolinase  22.86 
 
 
586 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4429  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.92 
 
 
581 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  22.05 
 
 
674 aa  86.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.36 
 
 
594 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  21.97 
 
 
585 aa  85.5  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  23.87 
 
 
581 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>