219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1834 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1152  hydantoinase B/oxoprolinase  45.2 
 
 
747 aa  721    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1342  hydantoinase B/oxoprolinase  43.48 
 
 
772 aa  696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1207  hydantoinase B/oxoprolinase  43.22 
 
 
748 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215827  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2242  hydantoinase B/oxoprolinase  47.71 
 
 
743 aa  733    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2506  hydantoinase B/oxoprolinase  41.89 
 
 
774 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.615482  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1162  hydantoinase B/oxoprolinase  44.25 
 
 
758 aa  708    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1834  hydantoinase B/oxoprolinase  100 
 
 
752 aa  1551    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11380  acetophenone carboxylase  43.86 
 
 
758 aa  700    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4359  hydantoinase B/oxoprolinase  43.99 
 
 
758 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1448  acetone carboxylase alpha subunit  40.8 
 
 
768 aa  633  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.674033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4899  hydantoinase B/oxoprolinase  41.34 
 
 
770 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.313887  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1847  hydantoinase B/oxoprolinase  29.74 
 
 
686 aa  266  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  26.28 
 
 
600 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3470  Hydantoinase B/oxoprolinase  26.26 
 
 
774 aa  171  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20920  acetone carboxylase alpha subunit; AcxB  26.89 
 
 
770 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.608945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1030  acetone carboxylase, alpha subunit  26.09 
 
 
779 aa  168  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127431  normal  0.789221 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6173  acetone carboxylase, alpha subunit  26.61 
 
 
774 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5522  Hydantoinase B/oxoprolinase  25.85 
 
 
776 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93174  normal  0.130662 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6151  hydantoinase B/oxoprolinase  25.9 
 
 
774 aa  164  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3510  hydantoinase B/oxoprolinase  25.34 
 
 
776 aa  162  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0356093  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1019  acetone carboxylase, alpha subunit  25.27 
 
 
774 aa  161  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4106  acetone carboxylase subunit alpha (or Hydantoinase B/oxoprolinase)  25.08 
 
 
774 aa  160  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1777  hydantoinase B/oxoprolinase  26.79 
 
 
737 aa  157  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0942  hydantoinase B/oxoprolinase  24.96 
 
 
774 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.98 
 
 
708 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.53 
 
 
681 aa  154  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4262  hydantoinase B/oxoprolinase  25.11 
 
 
771 aa  154  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.98 
 
 
708 aa  154  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.39 
 
 
775 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3604  hydantoinase B/oxoprolinase  25.46 
 
 
775 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918377  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2092  hydantoinase B/oxoprolinase  26.02 
 
 
736 aa  151  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.02 
 
 
646 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.46 
 
 
564 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  27.81 
 
 
581 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3716  hydantoinase B/oxoprolinase  25.42 
 
 
730 aa  137  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.207387  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  27.41 
 
 
581 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.88 
 
 
583 aa  135  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.99 
 
 
587 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  27.04 
 
 
581 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4409  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.76 
 
 
582 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  25.77 
 
 
578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.23 
 
 
634 aa  129  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.09 
 
 
657 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  24.42 
 
 
640 aa  127  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.44 
 
 
562 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  25.38 
 
 
671 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  25.52 
 
 
565 aa  124  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.2 
 
 
580 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4084  Hydantoinase B/oxoprolinase  26.01 
 
 
589 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1520  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.05 
 
 
588 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.11 
 
 
585 aa  118  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.68 
 
 
597 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.01 
 
 
586 aa  117  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.3 
 
 
845 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.2 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  24.66 
 
 
548 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  25.11 
 
 
563 aa  114  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.57 
 
 
616 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.95 
 
 
577 aa  111  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.87 
 
 
660 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.21 
 
 
561 aa  110  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2528  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.52 
 
 
629 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165308  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.38 
 
 
548 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.62 
 
 
582 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.4 
 
 
670 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.5 
 
 
594 aa  107  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.11 
 
 
572 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.94 
 
 
529 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.21 
 
 
577 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.45 
 
 
561 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.45 
 
 
579 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.21 
 
 
564 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  24.91 
 
 
647 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  23.49 
 
 
566 aa  103  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4825  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.01 
 
 
586 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.308896  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3812  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.57 
 
 
568 aa  102  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135188  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2132  Hydantoinase B/oxoprolinase  22.75 
 
 
626 aa  101  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.47 
 
 
521 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  25.3 
 
 
647 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2367  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.4 
 
 
530 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2266  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.75 
 
 
537 aa  99.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.419568  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.74 
 
 
577 aa  99.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.96 
 
 
598 aa  99.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.44 
 
 
624 aa  99  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.71 
 
 
651 aa  98.2  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.13 
 
 
519 aa  97.8  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.78 
 
 
601 aa  97.4  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0123  Hydantoinase B/oxoprolinase  25.7 
 
 
623 aa  97.4  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  24.26 
 
 
674 aa  97.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.96 
 
 
597 aa  95.9  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.18 
 
 
541 aa  95.9  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.29 
 
 
645 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.9 
 
 
568 aa  96.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0518569  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.47 
 
 
582 aa  96.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  23.92 
 
 
577 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4046  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.21 
 
 
559 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  decreased coverage  0.00136288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.29 
 
 
645 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.23 
 
 
628 aa  95.1  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1105  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.26 
 
 
568 aa  95.1  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.78 
 
 
568 aa  95.1  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>