219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4899 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_11380  acetophenone carboxylase  50.33 
 
 
758 aa  782    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1448  acetone carboxylase alpha subunit  66.62 
 
 
768 aa  1086    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.674033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1207  hydantoinase B/oxoprolinase  48.47 
 
 
748 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215827  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2242  hydantoinase B/oxoprolinase  48.11 
 
 
743 aa  730    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2506  hydantoinase B/oxoprolinase  88.39 
 
 
774 aa  1402    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.615482  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4899  hydantoinase B/oxoprolinase  100 
 
 
770 aa  1603    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.313887  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1162  hydantoinase B/oxoprolinase  49 
 
 
758 aa  771    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1342  hydantoinase B/oxoprolinase  49.8 
 
 
772 aa  787    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1834  hydantoinase B/oxoprolinase  41.34 
 
 
752 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1152  hydantoinase B/oxoprolinase  49.46 
 
 
747 aa  765    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4359  hydantoinase B/oxoprolinase  49.28 
 
 
758 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1847  hydantoinase B/oxoprolinase  29.08 
 
 
686 aa  266  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.36 
 
 
775 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  25.59 
 
 
600 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3470  Hydantoinase B/oxoprolinase  25.17 
 
 
774 aa  171  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1777  hydantoinase B/oxoprolinase  25.7 
 
 
737 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6173  acetone carboxylase, alpha subunit  24.18 
 
 
774 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4262  hydantoinase B/oxoprolinase  25.49 
 
 
771 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.75 
 
 
681 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3510  hydantoinase B/oxoprolinase  25 
 
 
776 aa  164  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0356093  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2092  hydantoinase B/oxoprolinase  25.39 
 
 
736 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20920  acetone carboxylase alpha subunit; AcxB  24.36 
 
 
770 aa  161  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.608945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1030  acetone carboxylase, alpha subunit  25.8 
 
 
779 aa  160  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127431  normal  0.789221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3604  hydantoinase B/oxoprolinase  24.21 
 
 
775 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918377  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.91 
 
 
564 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0942  hydantoinase B/oxoprolinase  23.33 
 
 
774 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4106  acetone carboxylase subunit alpha (or Hydantoinase B/oxoprolinase)  23.74 
 
 
774 aa  154  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1019  acetone carboxylase, alpha subunit  24.33 
 
 
774 aa  154  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6151  hydantoinase B/oxoprolinase  23.91 
 
 
774 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459932 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5522  Hydantoinase B/oxoprolinase  23.23 
 
 
776 aa  151  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93174  normal  0.130662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.33 
 
 
657 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.05 
 
 
577 aa  144  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.08 
 
 
580 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  24.39 
 
 
578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.42 
 
 
577 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.67 
 
 
708 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.67 
 
 
708 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3716  hydantoinase B/oxoprolinase  24.16 
 
 
730 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.207387  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.83 
 
 
583 aa  137  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.7 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.52 
 
 
601 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.7 
 
 
660 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.39 
 
 
529 aa  134  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.62 
 
 
562 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.42 
 
 
646 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  25.67 
 
 
671 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.2 
 
 
519 aa  129  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  24.94 
 
 
565 aa  129  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.44 
 
 
597 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.27 
 
 
645 aa  127  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.76 
 
 
594 aa  125  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.55 
 
 
575 aa  124  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.62 
 
 
577 aa  124  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  23.85 
 
 
640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  24.38 
 
 
566 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.02 
 
 
585 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.78 
 
 
616 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.38 
 
 
541 aa  121  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.86 
 
 
582 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  22.84 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.57 
 
 
515 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  23.95 
 
 
845 aa  119  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.06 
 
 
531 aa  117  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.48 
 
 
582 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.31 
 
 
645 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  23.99 
 
 
647 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2367  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.08 
 
 
530 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.22 
 
 
624 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  22.8 
 
 
674 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  23.47 
 
 
581 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  22.93 
 
 
647 aa  112  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.15 
 
 
548 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.85 
 
 
564 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.51 
 
 
558 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.68 
 
 
632 aa  111  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  23.47 
 
 
581 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  23.47 
 
 
581 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.37 
 
 
579 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.55 
 
 
521 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4084  Hydantoinase B/oxoprolinase  26.51 
 
 
589 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.72 
 
 
1206 aa  109  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  22.81 
 
 
548 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  22.56 
 
 
585 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  22.61 
 
 
574 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.08 
 
 
561 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.12 
 
 
589 aa  107  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.26 
 
 
539 aa  107  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.26 
 
 
515 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.98 
 
 
524 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  27.34 
 
 
1209 aa  105  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.54 
 
 
519 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.67 
 
 
568 aa  105  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0518569  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.26 
 
 
572 aa  105  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.88 
 
 
556 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4973  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.96 
 
 
652 aa  104  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  23.52 
 
 
613 aa  105  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  24.39 
 
 
579 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.4 
 
 
561 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.53 
 
 
1206 aa  104  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.43 
 
 
552 aa  104  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>