220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1777 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3510  hydantoinase B/oxoprolinase  47.62 
 
 
776 aa  708    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0356093  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1019  acetone carboxylase, alpha subunit  46.83 
 
 
774 aa  697    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6173  acetone carboxylase, alpha subunit  46.63 
 
 
774 aa  707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20920  acetone carboxylase alpha subunit; AcxB  48.07 
 
 
770 aa  696    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.608945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3604  hydantoinase B/oxoprolinase  46.99 
 
 
775 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918377  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5522  Hydantoinase B/oxoprolinase  46.31 
 
 
776 aa  695    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93174  normal  0.130662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2092  hydantoinase B/oxoprolinase  95.38 
 
 
736 aa  1425    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4106  acetone carboxylase subunit alpha (or Hydantoinase B/oxoprolinase)  47.38 
 
 
774 aa  705    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3470  Hydantoinase B/oxoprolinase  46.5 
 
 
774 aa  705    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281023  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1030  acetone carboxylase, alpha subunit  46.48 
 
 
779 aa  692    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127431  normal  0.789221 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6151  hydantoinase B/oxoprolinase  46.56 
 
 
774 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459932 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4262  hydantoinase B/oxoprolinase  46.58 
 
 
771 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1777  hydantoinase B/oxoprolinase  100 
 
 
737 aa  1529    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0942  hydantoinase B/oxoprolinase  46.69 
 
 
774 aa  687    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3716  hydantoinase B/oxoprolinase  41.36 
 
 
730 aa  568  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.207387  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1448  acetone carboxylase alpha subunit  27.07 
 
 
768 aa  192  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.674033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2506  hydantoinase B/oxoprolinase  25.94 
 
 
774 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.615482  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1152  hydantoinase B/oxoprolinase  26.75 
 
 
747 aa  178  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4359  hydantoinase B/oxoprolinase  24.42 
 
 
758 aa  173  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1834  hydantoinase B/oxoprolinase  26.79 
 
 
752 aa  170  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1847  hydantoinase B/oxoprolinase  26.37 
 
 
686 aa  168  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4899  hydantoinase B/oxoprolinase  25.44 
 
 
770 aa  168  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.313887  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.74 
 
 
775 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  27.32 
 
 
600 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1342  hydantoinase B/oxoprolinase  24.44 
 
 
772 aa  160  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11380  acetophenone carboxylase  24.18 
 
 
758 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1162  hydantoinase B/oxoprolinase  24.59 
 
 
758 aa  154  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1207  hydantoinase B/oxoprolinase  25.99 
 
 
748 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215827  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2242  hydantoinase B/oxoprolinase  25.41 
 
 
743 aa  145  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.97 
 
 
657 aa  132  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.11 
 
 
681 aa  131  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.08 
 
 
708 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.08 
 
 
708 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  24.2 
 
 
578 aa  125  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.21 
 
 
577 aa  123  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.21 
 
 
521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.19 
 
 
646 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.37 
 
 
579 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.27 
 
 
585 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.79 
 
 
564 aa  106  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.76 
 
 
597 aa  105  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  24.23 
 
 
674 aa  104  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.46 
 
 
580 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.16 
 
 
597 aa  101  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.29 
 
 
564 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.6 
 
 
572 aa  99  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.78 
 
 
577 aa  98.6  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.37 
 
 
587 aa  97.4  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  25.14 
 
 
1362 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.25 
 
 
575 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.27 
 
 
586 aa  95.1  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.74 
 
 
598 aa  95.1  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.57 
 
 
628 aa  94.7  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.45 
 
 
582 aa  94.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.72 
 
 
513 aa  94.4  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.64 
 
 
529 aa  93.6  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.54 
 
 
582 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2093  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.11 
 
 
1190 aa  93.2  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.1 
 
 
1220 aa  92.8  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  23.72 
 
 
574 aa  92.8  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  23.77 
 
 
1209 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.63 
 
 
514 aa  91.7  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  25.62 
 
 
1355 aa  91.3  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.03 
 
 
531 aa  91.3  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.03 
 
 
568 aa  91.3  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  23.51 
 
 
565 aa  90.9  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.29 
 
 
541 aa  91.3  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.28 
 
 
514 aa  90.9  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.68 
 
 
515 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1953  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.68 
 
 
515 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.76 
 
 
632 aa  90.5  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.98 
 
 
515 aa  90.5  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.73 
 
 
624 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.97 
 
 
634 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.84 
 
 
510 aa  89.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2266  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.9 
 
 
537 aa  88.6  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.419568  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  22.71 
 
 
581 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.42 
 
 
513 aa  88.6  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.01 
 
 
519 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.56 
 
 
561 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.12 
 
 
558 aa  88.2  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.36 
 
 
583 aa  88.2  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.78 
 
 
1206 aa  88.2  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.8 
 
 
1258 aa  87.8  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.01 
 
 
517 aa  87.4  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  24.11 
 
 
548 aa  87.4  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  23.1 
 
 
581 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4225  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.52 
 
 
588 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237131  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7017  hydantoin utilization protein  22.66 
 
 
571 aa  87  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4429  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.69 
 
 
581 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.34 
 
 
1242 aa  86.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.76 
 
 
548 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.71 
 
 
1210 aa  85.9  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2210  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.14 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.84 
 
 
594 aa  85.1  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.25 
 
 
1211 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  22.22 
 
 
563 aa  84.3  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.44 
 
 
562 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  22.94 
 
 
551 aa  84  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  22.22 
 
 
579 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>