218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1162 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1448  acetone carboxylase alpha subunit  48.88 
 
 		 768 aa  776    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.674033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4359  hydantoinase B/oxoprolinase  84.04 
 
 		 758 aa  1367    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11380  acetophenone carboxylase  86.94 
 
 		 758 aa  1407    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1207  hydantoinase B/oxoprolinase  50.41 
 
 		 748 aa  776    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2242  hydantoinase B/oxoprolinase  57.47 
 
 		 743 aa  895    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2506  hydantoinase B/oxoprolinase  49.67 
 
 		 774 aa  787    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.615482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1342  hydantoinase B/oxoprolinase  87.6 
 
 		 772 aa  1404    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4899  hydantoinase B/oxoprolinase  49 
 
 		 770 aa  736    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.313887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1162  hydantoinase B/oxoprolinase  100 
 
 		 758 aa  1588    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1834  hydantoinase B/oxoprolinase  44.25 
 
 		 752 aa  708    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1152  hydantoinase B/oxoprolinase  55.81 
 
 		 747 aa  882    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1847  hydantoinase B/oxoprolinase  32.03 
 
 		 686 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  24.76 
 
 		 600 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6173  acetone carboxylase, alpha subunit  23.59 
 
 		 774 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4262  hydantoinase B/oxoprolinase  24.52 
 
 		 771 aa  168  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3604  hydantoinase B/oxoprolinase  24.63 
 
 		 775 aa  167  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5522  Hydantoinase B/oxoprolinase  25.07 
 
 		 776 aa  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93174  normal  0.130662 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3470  Hydantoinase B/oxoprolinase  24.44 
 
 		 774 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281023  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3716  hydantoinase B/oxoprolinase  23.74 
 
 		 730 aa  165  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.207387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.52 
 
 		 775 aa  164  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1030  acetone carboxylase, alpha subunit  25.08 
 
 		 779 aa  163  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127431  normal  0.789221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0942  hydantoinase B/oxoprolinase  25.48 
 
 		 774 aa  163  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3510  hydantoinase B/oxoprolinase  25.33 
 
 		 776 aa  162  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0356093  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.67 
 
 		 708 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.67 
 
 		 708 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4106  acetone carboxylase subunit alpha (or Hydantoinase B/oxoprolinase)  23.96 
 
 		 774 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1019  acetone carboxylase, alpha subunit  23.72 
 
 		 774 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20920  acetone carboxylase alpha subunit; AcxB  24.85 
 
 		 770 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.608945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.8 
 
 		 646 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6151  hydantoinase B/oxoprolinase  24.48 
 
 		 774 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.75 
 
 		 657 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1777  hydantoinase B/oxoprolinase  24.53 
 
 		 737 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2092  hydantoinase B/oxoprolinase  24.29 
 
 		 736 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.22 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.2 
 
 		 681 aa  137  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.64 
 
 		 585 aa  134  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.91 
 
 		 586 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.18 
 
 		 580 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  26.29 
 
 		 565 aa  124  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.52 
 
 		 583 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.96 
 
 		 556 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.92 
 
 		 562 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.82 
 
 		 564 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.47 
 
 		 577 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  26.92 
 
 		 845 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4825  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.88 
 
 		 586 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.308896  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  24.43 
 
 		 647 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.39 
 
 		 529 aa  111  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.99 
 
 		 587 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.06 
 
 		 521 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  23.22 
 
 		 563 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.19 
 
 		 660 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.8 
 
 		 519 aa  108  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  23.97 
 
 		 613 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.5 
 
 		 561 aa  107  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.17 
 
 		 634 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.4 
 
 		 577 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.17 
 
 		 597 aa  107  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.96 
 
 		 577 aa  107  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  23.68 
 
 		 671 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.74 
 
 		 531 aa  104  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  22.59 
 
 		 640 aa  104  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.26 
 
 		 582 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.67 
 
 		 624 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  21.27 
 
 		 647 aa  101  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2132  Hydantoinase B/oxoprolinase  22.14 
 
 		 626 aa  101  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.22 
 
 		 561 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.19 
 
 		 541 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  22.3 
 
 		 548 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  21.85 
 
 		 578 aa  99  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.22 
 
 		 1206 aa  98.2  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.4 
 
 		 629 aa  97.8  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  26.14 
 
 		 577 aa  97.8  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  23.97 
 
 		 574 aa  96.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  24.13 
 
 		 611 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.4 
 
 		 579 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  21.97 
 
 		 1277 aa  95.1  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.71 
 
 		 575 aa  95.1  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.68 
 
 		 645 aa  95.1  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.17 
 
 		 628 aa  95.1  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.85 
 
 		 548 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.29 
 
 		 539 aa  94.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  21.26 
 
 		 566 aa  94.4  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.72 
 
 		 589 aa  92.8  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.57 
 
 		 519 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.44 
 
 		 633 aa  91.3  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.24 
 
 		 584 aa  90.9  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.92 
 
 		 645 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.13 
 
 		 1213 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  23.15 
 
 		 581 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2367  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.85 
 
 		 530 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1912  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.96 
 
 		 569 aa  90.1  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.25 
 
 		 1242 aa  90.1  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.16 
 
 		 1211 aa  90.1  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4409  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.54 
 
 		 582 aa  89.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.69 
 
 		 572 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  22.61 
 
 		 551 aa  89  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3812  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.14 
 
 		 568 aa  88.6  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135188  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  21.98 
 
 		 674 aa  88.2  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  23.62 
 
 		 581 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>