132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0974 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0974  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  100 
 
 
413 aa  837    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0517  hypothetical protein  35.59 
 
 
404 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00645936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3030  hypothetical protein  34.3 
 
 
398 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.278089  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1513  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  33.56 
 
 
424 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2703  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  32.88 
 
 
424 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000043685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1421  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  29.56 
 
 
409 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0738  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  28.5 
 
 
403 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112629  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1067  hypothetical protein  28.75 
 
 
465 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1400  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  30.75 
 
 
404 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2700  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  28.29 
 
 
405 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000230208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1516  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  30.4 
 
 
405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  26.18 
 
 
634 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.85 
 
 
637 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  25.16 
 
 
641 aa  93.2  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  25.75 
 
 
624 aa  93.2  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  27.07 
 
 
606 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  26.59 
 
 
606 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  23.91 
 
 
624 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  26.32 
 
 
606 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2907  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  27.11 
 
 
403 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  27.92 
 
 
606 aa  86.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.3 
 
 
644 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.29 
 
 
642 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.79 
 
 
605 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.78 
 
 
633 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.38 
 
 
660 aa  81.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  21.35 
 
 
622 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.42 
 
 
649 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  24.93 
 
 
480 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.71 
 
 
613 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  25.89 
 
 
618 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.58 
 
 
649 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.43 
 
 
650 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.6 
 
 
667 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  25 
 
 
623 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.87 
 
 
636 aa  73.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  25.48 
 
 
603 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.09 
 
 
600 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  24.05 
 
 
629 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  23.89 
 
 
641 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  26.57 
 
 
485 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  22.86 
 
 
614 aa  70.5  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  24.11 
 
 
623 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  24.51 
 
 
625 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  24.91 
 
 
629 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  23.34 
 
 
639 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  25.77 
 
 
638 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  25.84 
 
 
613 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  22.41 
 
 
629 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  22.93 
 
 
645 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  21.21 
 
 
615 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.73 
 
 
635 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.63 
 
 
615 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  24.63 
 
 
615 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  24.63 
 
 
615 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.81 
 
 
603 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  25.27 
 
 
620 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  24.63 
 
 
615 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  20.53 
 
 
604 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2005  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  26.86 
 
 
375 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  25.5 
 
 
481 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  24.37 
 
 
615 aa  63.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  21.48 
 
 
633 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  23.37 
 
 
486 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.53 
 
 
605 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  24.91 
 
 
620 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  24.91 
 
 
620 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  23.84 
 
 
625 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  24.73 
 
 
615 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  21.93 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  22.76 
 
 
615 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  28.33 
 
 
603 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  23.34 
 
 
648 aa  60.5  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  22.34 
 
 
629 aa  60.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  22.74 
 
 
478 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  22.15 
 
 
627 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  23.7 
 
 
615 aa  59.7  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
605 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.79 
 
 
596 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  22.69 
 
 
615 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  25 
 
 
485 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  23.53 
 
 
620 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0670  cyclic nucleotide-binding protein  22.92 
 
 
625 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  25.09 
 
 
663 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  22.66 
 
 
626 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  21.22 
 
 
626 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  22.52 
 
 
641 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2004  cyclic nucleotide-binding protein  24.19 
 
 
622 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.429129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  23.22 
 
 
618 aa  57  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.64 
 
 
596 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  22.79 
 
 
615 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  25 
 
 
643 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  28.76 
 
 
598 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  24.91 
 
 
622 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  23.44 
 
 
639 aa  56.6  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  23.6 
 
 
637 aa  56.6  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  23.57 
 
 
646 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  22.03 
 
 
626 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  23.25 
 
 
615 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  21.95 
 
 
610 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>