84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2907 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2907  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  100 
 
 		 403 aa  809    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0517  hypothetical protein  29.66 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00645936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3030  hypothetical protein  30.6 
 
 		 398 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.278089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2700  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  29.2 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000230208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1516  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  29.65 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1421  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  28.66 
 
 		 409 aa  99.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0738  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  26.93 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0974  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  27.11 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1067  hypothetical protein  26.24 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1400  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  26.52 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2703  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  27.21 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000043685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  26.2 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1513  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  25.76 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.41 
 
 		 637 aa  69.7  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  23.77 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.61 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  26.6 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  21.69 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.53 
 
 		 660 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  23.59 
 
 		 641 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  25.99 
 
 		 623 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  25.6 
 
 		 641 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  25.83 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  25.11 
 
 		 623 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  25.09 
 
 		 615 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  26.15 
 
 		 615 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.49 
 
 		 649 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  25.3 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  25.08 
 
 		 615 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  21.91 
 
 		 618 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  20.36 
 
 		 635 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  21.94 
 
 		 622 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.8 
 
 		 615 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  25.8 
 
 		 615 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 620 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  20.74 
 
 		 639 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  25.8 
 
 		 615 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  23.86 
 
 		 636 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  22.96 
 
 		 478 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  21.05 
 
 		 629 aa  49.7  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 605 aa  49.7  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  24.04 
 
 		 625 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  22.85 
 
 		 633 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  22.71 
 
 		 637 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  22.73 
 
 		 629 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 		 615 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  24.58 
 
 		 620 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  20.89 
 
 		 625 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  22.14 
 
 		 644 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  23.05 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  24 
 
 		 601 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  25.23 
 
 		 634 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  21.8 
 
 		 627 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  25.12 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  24.44 
 
 		 624 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  23.11 
 
 		 629 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  21.86 
 
 		 650 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  25.52 
 
 		 620 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  25.52 
 
 		 620 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  25.33 
 
 		 615 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  22.89 
 
 		 626 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  27.17 
 
 		 615 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  23.77 
 
 		 561 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  23.73 
 
 		 641 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  20.85 
 
 		 649 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.68 
 
 		 603 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  26.48 
 
 		 614 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  21.98 
 
 		 608 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.68 
 
 		 603 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  20.95 
 
 		 624 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.24 
 
 		 603 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  22.63 
 
 		 625 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  20.92 
 
 		 606 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.41 
 
 		 605 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2005  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  27.48 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  24.92 
 
 		 618 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.19 
 
 		 601 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.19 
 
 		 601 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  20.21 
 
 		 645 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.09 
 
 		 667 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.96 
 
 		 603 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  21.8 
 
 		 629 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  23.79 
 
 		 626 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  28.76 
 
 		 603 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>