87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1513 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1513  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  100 
 
 		 424 aa  848    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2703  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  94.34 
 
 		 424 aa  771    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000043685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0974  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  33.56 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0517  hypothetical protein  30.65 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00645936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3030  hypothetical protein  29.63 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.278089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1400  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  31.89 
 
 		 404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0738  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  28.24 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1067  hypothetical protein  30.63 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1421  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  29.38 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1516  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  29.43 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2700  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  27.59 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000230208 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 		 600 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  25.37 
 
 		 613 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  25.15 
 
 		 641 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  24.83 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  24.23 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  27.61 
 
 		 625 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.06 
 
 		 636 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 		 624 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.62 
 
 		 633 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.77 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.18 
 
 		 649 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  24.4 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.37 
 
 		 660 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  25.54 
 
 		 601 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  22.78 
 
 		 642 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 667 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  24.5 
 
 		 629 aa  60.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.78 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2907  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  25.76 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  23.91 
 
 		 637 aa  60.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  23.97 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  22.92 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  24.47 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.44 
 
 		 606 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.24 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  23 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  23.93 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  23.93 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25 
 
 		 603 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  28.11 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  24.16 
 
 		 622 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  24.37 
 
 		 634 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  25.19 
 
 		 599 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  25 
 
 		 629 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  21.45 
 
 		 629 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  25.53 
 
 		 626 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  22.26 
 
 		 629 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  24.81 
 
 		 599 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 		 605 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  21.64 
 
 		 639 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  29.61 
 
 		 638 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  24.33 
 
 		 606 aa  50.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  22.99 
 
 		 627 aa  50.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.15 
 
 		 635 aa  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  24.44 
 
 		 615 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  27.65 
 
 		 574 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  23.03 
 
 		 626 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.4 
 
 		 644 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  27.33 
 
 		 645 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2049  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  24.73 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82123  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  22.26 
 
 		 625 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  22.91 
 
 		 648 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  20.71 
 
 		 625 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  32.91 
 
 		 565 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.4 
 
 		 613 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0670  cyclic nucleotide-binding protein  33.8 
 
 		 625 aa  47  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  28.57 
 
 		 637 aa  46.6  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 605 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 604 aa  46.6  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  25.36 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 		 643 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  22.4 
 
 		 641 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.69 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  33 
 
 		 609 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  27.45 
 
 		 610 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  20 
 
 		 607 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  20.58 
 
 		 608 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  21.65 
 
 		 641 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  25.28 
 
 		 603 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  20.32 
 
 		 615 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  20.16 
 
 		 561 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  29.31 
 
 		 485 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  20.38 
 
 		 614 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  30.5 
 
 		 725 aa  43.5  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  25.66 
 
 		 622 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>