159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2049 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2049  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  100 
 
 
373 aa  726    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82123  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  45.27 
 
 
615 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  33.53 
 
 
624 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  36.34 
 
 
606 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  37.91 
 
 
603 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  36.34 
 
 
606 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  36.04 
 
 
606 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  33.92 
 
 
624 aa  196  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  35.67 
 
 
606 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.42 
 
 
605 aa  182  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.94 
 
 
613 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  30.7 
 
 
614 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 
623 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 
623 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  30.75 
 
 
615 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  30.72 
 
 
648 aa  162  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.68 
 
 
615 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  38.34 
 
 
603 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.68 
 
 
615 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.04 
 
 
601 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.68 
 
 
615 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  38.04 
 
 
601 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
615 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.93 
 
 
596 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  35.71 
 
 
601 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  30.17 
 
 
615 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  29.97 
 
 
620 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  29.97 
 
 
620 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  31.18 
 
 
663 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  29.68 
 
 
620 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  29.39 
 
 
620 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  36.8 
 
 
574 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.53 
 
 
606 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  31.4 
 
 
633 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  30.06 
 
 
642 aa  155  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  36.99 
 
 
601 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
618 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.25 
 
 
478 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
615 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  30.45 
 
 
644 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  28.36 
 
 
615 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  31.49 
 
 
625 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  28.91 
 
 
622 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  31.63 
 
 
645 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  39.93 
 
 
596 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  30.21 
 
 
618 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  28.66 
 
 
615 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  32.53 
 
 
629 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
639 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  31.94 
 
 
629 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  31.94 
 
 
629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  28.36 
 
 
626 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  31.94 
 
 
629 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  30.33 
 
 
615 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  31.94 
 
 
641 aa  146  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  30.21 
 
 
627 aa  145  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
645 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  31.85 
 
 
641 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.77 
 
 
485 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 
645 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  30.06 
 
 
644 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.91 
 
 
635 aa  143  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 
645 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  30.37 
 
 
626 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
645 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3826  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  40.39 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257378 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.25 
 
 
603 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 
605 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  29.86 
 
 
626 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.56 
 
 
603 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  29.62 
 
 
625 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  33.45 
 
 
637 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 
603 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  32.39 
 
 
634 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  26.18 
 
 
639 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.64 
 
 
648 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.56 
 
 
603 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  30.59 
 
 
645 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  28.82 
 
 
638 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  29.64 
 
 
646 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  29.86 
 
 
628 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1516  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  33.98 
 
 
405 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1067  hypothetical protein  30.53 
 
 
465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  27.33 
 
 
480 aa  135  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  30.42 
 
 
646 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  29.17 
 
 
622 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2700  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  33.33 
 
 
405 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000230208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.01 
 
 
637 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  37.46 
 
 
598 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3142  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 
608 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  31.56 
 
 
641 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.91 
 
 
625 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.54 
 
 
633 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.86 
 
 
667 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.77 
 
 
649 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  33.54 
 
 
617 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  30.86 
 
 
629 aa  126  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  29.64 
 
 
486 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  30.54 
 
 
643 aa  126  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  27.33 
 
 
613 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>