More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3514 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3514  carboxyl transferase  100 
 
 		 470 aa  916    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4812  carboxyl transferase  70.78 
 
 		 475 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3382  propionyl-CoA carboxylase  74.26 
 
 		 474 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3624  propionyl-CoA carboxylase  74.11 
 
 		 474 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12276  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 6 accD6  71.96 
 
 		 473 aa  632  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000992935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2037  carboxyl transferase  72.71 
 
 		 493 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00850796  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3368  propionyl-CoA carboxylase  71.96 
 
 		 473 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3430  propionyl-CoA carboxylase  71.96 
 
 		 473 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2775  propionyl-CoA carboxylase  70.98 
 
 		 478 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337324  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3379  propionyl-CoA carboxylase  71.96 
 
 		 473 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3758  propionyl-CoA carboxylase  69.67 
 
 		 477 aa  624  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3124  carboxyl transferase  71.76 
 
 		 483 aa  619  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.714277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1986  propionyl-CoA carboxylase  71.65 
 
 		 476 aa  589  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.176304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6813  Propionyl-CoA carboxylase  67.89 
 
 		 486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2373  carboxyl transferase  69.47 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463514  normal  0.0764013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7058  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  68.93 
 
 		 473 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11990  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  65.75 
 
 		 495 aa  545  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.401761  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1261  propionyl-CoA carboxylase  65.29 
 
 		 489 aa  542  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0874  propionyl-CoA carboxylase  70.46 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3485  propionyl-CoA carboxylase  66.31 
 
 		 469 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3339  propionyl-CoA carboxylase  64.54 
 
 		 486 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1637  carboxyl transferase  67.75 
 
 		 481 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0127226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2764  propionyl-CoA carboxylase  67.17 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3085  propionyl-CoA carboxylase  61.46 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  47.87 
 
 		 530 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  48.34 
 
 		 536 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  49.01 
 
 		 531 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  48 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  48.23 
 
 		 536 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  46.41 
 
 		 530 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  47.45 
 
 		 527 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  45.25 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  46.33 
 
 		 524 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  47.11 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.31 
 
 		 537 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.54 
 
 		 527 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.57 
 
 		 532 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  46.17 
 
 		 549 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  45.43 
 
 		 527 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  47.23 
 
 		 542 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  45.76 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  46.72 
 
 		 543 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  45.43 
 
 		 526 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  45.96 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  46.09 
 
 		 551 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  44.87 
 
 		 527 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  47.01 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  46.58 
 
 		 541 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  44.52 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  44.86 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  44.74 
 
 		 538 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  41.04 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  41.67 
 
 		 542 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  44.18 
 
 		 548 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  42.57 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  42.41 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  42.06 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  41.04 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  41.37 
 
 		 523 aa  365  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  43.47 
 
 		 517 aa  365  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  42.02 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  45.29 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  46.92 
 
 		 534 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  42.6 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.21 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  43.82 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  43.42 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  44.37 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  41.48 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  43.42 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  45.3 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  43.37 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  43.42 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  44.59 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  43.69 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  40.96 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  42.28 
 
 		 508 aa  362  6e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  46.15 
 
 		 529 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  41.43 
 
 		 516 aa  362  6e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  45.21 
 
 		 559 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  42.47 
 
 		 518 aa  362  9e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  45.41 
 
 		 517 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  41.46 
 
 		 516 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  42.65 
 
 		 516 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  41.96 
 
 		 516 aa  359  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  42.44 
 
 		 516 aa  359  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  42.51 
 
 		 517 aa  359  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  43.02 
 
 		 519 aa  359  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  42.89 
 
 		 512 aa  358  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  40.71 
 
 		 512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  43.6 
 
 		 510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  43.24 
 
 		 510 aa  356  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  43.95 
 
 		 510 aa  356  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  44.52 
 
 		 510 aa  356  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  42.02 
 
 		 514 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  41.26 
 
 		 514 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  43.79 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  42.47 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1342  carboxyl transferase  41.83 
 
 		 511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525317  normal  0.223983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  42.12 
 
 		 513 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>