More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3758 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3124  carboxyl transferase  76.69 
 
 
483 aa  693    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.714277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2775  propionyl-CoA carboxylase  95.19 
 
 
478 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337324  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3368  propionyl-CoA carboxylase  91.9 
 
 
473 aa  848    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3430  propionyl-CoA carboxylase  91.9 
 
 
473 aa  848    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12276  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 6 accD6  88.49 
 
 
473 aa  835    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000992935  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3758  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
477 aa  961    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3379  propionyl-CoA carboxylase  91.9 
 
 
473 aa  848    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319098  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2037  carboxyl transferase  68.33 
 
 
493 aa  618  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00850796  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3514  carboxyl transferase  69.67 
 
 
470 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4812  carboxyl transferase  63.64 
 
 
475 aa  578  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1986  propionyl-CoA carboxylase  64.45 
 
 
476 aa  561  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3382  propionyl-CoA carboxylase  63.47 
 
 
474 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3624  propionyl-CoA carboxylase  62.37 
 
 
474 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2373  carboxyl transferase  64.91 
 
 
474 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463514  normal  0.0764013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7058  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  62.13 
 
 
473 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6813  Propionyl-CoA carboxylase  60.68 
 
 
486 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1637  carboxyl transferase  63.56 
 
 
481 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0127226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11990  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  61.81 
 
 
495 aa  525  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.401761  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2764  propionyl-CoA carboxylase  62.92 
 
 
479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3339  propionyl-CoA carboxylase  60.55 
 
 
486 aa  504  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1261  propionyl-CoA carboxylase  57.02 
 
 
489 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0874  propionyl-CoA carboxylase  62.63 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3485  propionyl-CoA carboxylase  58.3 
 
 
469 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265795  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3085  propionyl-CoA carboxylase  56.34 
 
 
505 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  44.19 
 
 
536 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  45.45 
 
 
530 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  45.54 
 
 
527 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  46 
 
 
531 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  43.74 
 
 
542 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  43.33 
 
 
534 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  45.09 
 
 
524 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.62 
 
 
537 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  42.95 
 
 
529 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  45.66 
 
 
536 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  44.87 
 
 
527 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  42.68 
 
 
530 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  43.99 
 
 
543 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.27 
 
 
532 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  42.33 
 
 
542 aa  362  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  41.6 
 
 
526 aa  361  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  42.76 
 
 
548 aa  359  5e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  43.64 
 
 
549 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  41.25 
 
 
518 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  45.07 
 
 
518 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  41.7 
 
 
546 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  44.1 
 
 
529 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  44.69 
 
 
541 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  42.58 
 
 
542 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  42.83 
 
 
531 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  42.86 
 
 
538 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  42.54 
 
 
556 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  42.54 
 
 
556 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  42.54 
 
 
556 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  43.82 
 
 
550 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  42.15 
 
 
540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  43.24 
 
 
513 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  41.96 
 
 
512 aa  352  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  41.65 
 
 
527 aa  352  8.999999999999999e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  40.62 
 
 
516 aa  351  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  43.3 
 
 
551 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  44.17 
 
 
510 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  42.41 
 
 
516 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  41.37 
 
 
512 aa  350  4e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  41.44 
 
 
516 aa  350  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  40 
 
 
517 aa  348  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  41.53 
 
 
516 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  39.75 
 
 
524 aa  348  1e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  40.87 
 
 
513 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  41.65 
 
 
527 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.33 
 
 
529 aa  347  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  41.42 
 
 
513 aa  347  3e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  39.5 
 
 
523 aa  346  5e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  42.67 
 
 
517 aa  346  5e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  44.3 
 
 
510 aa  346  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  40.89 
 
 
552 aa  345  8.999999999999999e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  41.38 
 
 
515 aa  345  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  41.54 
 
 
522 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  41.35 
 
 
516 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  40.37 
 
 
516 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  40.62 
 
 
527 aa  343  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  39.05 
 
 
508 aa  343  5.999999999999999e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  42.59 
 
 
514 aa  342  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  40.45 
 
 
531 aa  342  7e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  41.16 
 
 
518 aa  342  7e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  39.42 
 
 
516 aa  342  7e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  41.43 
 
 
515 aa  342  9e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  41.13 
 
 
519 aa  342  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  42.95 
 
 
529 aa  342  9e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  40.17 
 
 
516 aa  342  9e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  41.07 
 
 
517 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4157  carboxyl transferase  42.28 
 
 
475 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  42.28 
 
 
559 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  39.88 
 
 
514 aa  338  9e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  41.85 
 
 
534 aa  338  9e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  43.27 
 
 
510 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  42.54 
 
 
510 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  43.27 
 
 
510 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  40.81 
 
 
510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1099  propionyl-CoA carboxylase  41.03 
 
 
535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  40.79 
 
 
510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>