More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11990 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11990  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  100 
 
 		 495 aa  984    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.401761  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6813  Propionyl-CoA carboxylase  71.58 
 
 		 486 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1986  propionyl-CoA carboxylase  68.57 
 
 		 476 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3368  propionyl-CoA carboxylase  63.08 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3430  propionyl-CoA carboxylase  63.08 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3379  propionyl-CoA carboxylase  63.08 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0874  propionyl-CoA carboxylase  68.07 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2775  propionyl-CoA carboxylase  62.74 
 
 		 478 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337324  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3758  propionyl-CoA carboxylase  61.81 
 
 		 477 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3382  propionyl-CoA carboxylase  63.31 
 
 		 474 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1637  carboxyl transferase  67.16 
 
 		 481 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0127226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3624  propionyl-CoA carboxylase  63.52 
 
 		 474 aa  548  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12276  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 6 accD6  60.76 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000992935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1261  propionyl-CoA carboxylase  60.83 
 
 		 489 aa  542  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2373  carboxyl transferase  64.74 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463514  normal  0.0764013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7058  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  64.19 
 
 		 473 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3124  carboxyl transferase  60.34 
 
 		 483 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.714277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4812  carboxyl transferase  59.92 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3514  carboxyl transferase  63.71 
 
 		 470 aa  534  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3485  propionyl-CoA carboxylase  63.45 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2037  carboxyl transferase  60.68 
 
 		 493 aa  523  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00850796  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3339  propionyl-CoA carboxylase  57.41 
 
 		 486 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3085  propionyl-CoA carboxylase  56.25 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2764  propionyl-CoA carboxylase  58.66 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  42.69 
 
 		 536 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  42.64 
 
 		 549 aa  362  8e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  40.2 
 
 		 523 aa  360  3e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  44.44 
 
 		 524 aa  360  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  43.35 
 
 		 527 aa  359  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  43.25 
 
 		 531 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  44.37 
 
 		 536 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  42.92 
 
 		 530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  43.28 
 
 		 529 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  43.59 
 
 		 530 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  40.32 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  42.61 
 
 		 551 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  43.35 
 
 		 527 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  40.2 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  41.77 
 
 		 546 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  43.04 
 
 		 552 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  42.4 
 
 		 534 aa  350  5e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  42.73 
 
 		 559 aa  349  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  42.86 
 
 		 518 aa  349  8e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  41.6 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  39.78 
 
 		 514 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  40.85 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  42.38 
 
 		 543 aa  347  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  41.96 
 
 		 550 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  39.88 
 
 		 540 aa  346  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  38.18 
 
 		 513 aa  346  5e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  39.29 
 
 		 516 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  42.55 
 
 		 541 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.22 
 
 		 529 aa  344  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  40.94 
 
 		 542 aa  344  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  40.64 
 
 		 556 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  40.64 
 
 		 556 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  39.61 
 
 		 516 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  40.64 
 
 		 556 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  38.75 
 
 		 518 aa  343  4e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  40 
 
 		 508 aa  343  5e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  39.71 
 
 		 516 aa  343  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  42.18 
 
 		 529 aa  342  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  41.24 
 
 		 542 aa  342  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  39.35 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  40.94 
 
 		 538 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  41.61 
 
 		 516 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  39.92 
 
 		 531 aa  340  4e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  41.16 
 
 		 527 aa  339  5.9999999999999996e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  42.89 
 
 		 531 aa  339  8e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  41.09 
 
 		 517 aa  339  9e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  38.45 
 
 		 522 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  40.17 
 
 		 519 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  37.9 
 
 		 517 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  39.43 
 
 		 512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  38.23 
 
 		 516 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  38.23 
 
 		 516 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  38.56 
 
 		 515 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  41.39 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  39.48 
 
 		 517 aa  336  5e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  41.63 
 
 		 526 aa  336  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.03 
 
 		 532 aa  336  7e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  40.48 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  40.22 
 
 		 522 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  39 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  37.65 
 
 		 516 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  42.38 
 
 		 510 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  38.94 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  37.3 
 
 		 518 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  42.34 
 
 		 522 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  41.62 
 
 		 529 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  43.01 
 
 		 514 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  38.96 
 
 		 531 aa  333  4e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  40.95 
 
 		 527 aa  333  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  41.81 
 
 		 542 aa  332  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  38.43 
 
 		 515 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  40.39 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  40.39 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  42.46 
 
 		 534 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  40.28 
 
 		 510 aa  329  8e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  39.22 
 
 		 516 aa  329  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>