More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2764 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2764  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 479 aa  934    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2037  carboxyl transferase  67.67 
 
 		 493 aa  586  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00850796  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4812  carboxyl transferase  62.72 
 
 		 475 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3758  propionyl-CoA carboxylase  62.92 
 
 		 477 aa  552  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12276  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 6 accD6  63.75 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000992935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2775  propionyl-CoA carboxylase  63.52 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337324  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3379  propionyl-CoA carboxylase  63.18 
 
 		 473 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3368  propionyl-CoA carboxylase  63.18 
 
 		 473 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3124  carboxyl transferase  62.47 
 
 		 483 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.714277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3430  propionyl-CoA carboxylase  63.18 
 
 		 473 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3382  propionyl-CoA carboxylase  64.39 
 
 		 474 aa  538  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3624  propionyl-CoA carboxylase  62.11 
 
 		 474 aa  522  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3514  carboxyl transferase  67.17 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3339  propionyl-CoA carboxylase  63.66 
 
 		 486 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2373  carboxyl transferase  63.54 
 
 		 474 aa  498  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463514  normal  0.0764013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7058  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  64.3 
 
 		 473 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3085  propionyl-CoA carboxylase  60.91 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1637  carboxyl transferase  63.71 
 
 		 481 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0127226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1986  propionyl-CoA carboxylase  60.25 
 
 		 476 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1261  propionyl-CoA carboxylase  58.67 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6813  Propionyl-CoA carboxylase  58.9 
 
 		 486 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3485  propionyl-CoA carboxylase  59.87 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11990  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  59.13 
 
 		 495 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.401761  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0874  propionyl-CoA carboxylase  61.97 
 
 		 474 aa  472  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  45.06 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  44.26 
 
 		 524 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  43.94 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  44.24 
 
 		 527 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  44.01 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.45 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  43.33 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  44.09 
 
 		 531 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  43.74 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  43 
 
 		 534 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.81 
 
 		 532 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.12 
 
 		 537 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  43.9 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  44.2 
 
 		 536 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  45.08 
 
 		 550 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  39.63 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  42.42 
 
 		 536 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  44.08 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  43.29 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  42.67 
 
 		 518 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  43.07 
 
 		 531 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  41.96 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  42.63 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  44.83 
 
 		 514 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  44.91 
 
 		 542 aa  363  4e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  42.83 
 
 		 549 aa  363  5.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  42.39 
 
 		 529 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  43.12 
 
 		 516 aa  362  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  43.29 
 
 		 551 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  43.27 
 
 		 541 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  41.56 
 
 		 517 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  42.24 
 
 		 514 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  45.08 
 
 		 534 aa  360  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  43.33 
 
 		 519 aa  360  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  43.24 
 
 		 514 aa  359  8e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  42.83 
 
 		 516 aa  358  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  44.96 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  44.4 
 
 		 517 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  41.78 
 
 		 514 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.2 
 
 		 529 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  40.66 
 
 		 540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  41.5 
 
 		 546 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  40.53 
 
 		 514 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  41.29 
 
 		 513 aa  356  5.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  41.9 
 
 		 556 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  41.9 
 
 		 556 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  41.9 
 
 		 556 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  39.87 
 
 		 516 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  41.78 
 
 		 523 aa  355  8.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  42.11 
 
 		 548 aa  355  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  42.42 
 
 		 542 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  43.17 
 
 		 531 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  44.18 
 
 		 520 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  44.05 
 
 		 518 aa  352  7e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  39.67 
 
 		 516 aa  352  7e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  40.89 
 
 		 513 aa  352  8e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  41.56 
 
 		 522 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  38.22 
 
 		 508 aa  352  1e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  40.94 
 
 		 512 aa  351  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  43.44 
 
 		 543 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  40.26 
 
 		 515 aa  351  2e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  40.82 
 
 		 513 aa  350  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  41.03 
 
 		 522 aa  351  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  41.43 
 
 		 517 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  42.29 
 
 		 522 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  42.31 
 
 		 538 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  42.42 
 
 		 513 aa  349  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  42.09 
 
 		 519 aa  349  6e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  40.41 
 
 		 520 aa  349  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  43.41 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  43.2 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  42.74 
 
 		 542 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  41.91 
 
 		 531 aa  347  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  41.56 
 
 		 524 aa  347  2e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1099  propionyl-CoA carboxylase  42.04 
 
 		 535 aa  347  3e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  43.29 
 
 		 519 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>