More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1637 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7058  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  75.88 
 
 
473 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1637  carboxyl transferase  100 
 
 
481 aa  946    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0127226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2373  carboxyl transferase  75.93 
 
 
474 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463514  normal  0.0764013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3368  propionyl-CoA carboxylase  65.89 
 
 
473 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1986  propionyl-CoA carboxylase  68.08 
 
 
476 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3430  propionyl-CoA carboxylase  65.89 
 
 
473 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3382  propionyl-CoA carboxylase  67.08 
 
 
474 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3379  propionyl-CoA carboxylase  65.89 
 
 
473 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319098  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4812  carboxyl transferase  65.55 
 
 
475 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6813  Propionyl-CoA carboxylase  69.23 
 
 
486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3624  propionyl-CoA carboxylase  68.31 
 
 
474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3758  propionyl-CoA carboxylase  63.56 
 
 
477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12276  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 6 accD6  64.83 
 
 
473 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000992935  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2775  propionyl-CoA carboxylase  63.43 
 
 
478 aa  567  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337324  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11990  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  67.16 
 
 
495 aa  565  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.401761  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2037  carboxyl transferase  66.31 
 
 
493 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00850796  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0874  propionyl-CoA carboxylase  70.91 
 
 
474 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3124  carboxyl transferase  61.89 
 
 
483 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.714277  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3514  carboxyl transferase  67.75 
 
 
470 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1261  propionyl-CoA carboxylase  61.09 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3485  propionyl-CoA carboxylase  63.25 
 
 
469 aa  514  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265795  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2764  propionyl-CoA carboxylase  63.71 
 
 
479 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3339  propionyl-CoA carboxylase  60.97 
 
 
486 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3085  propionyl-CoA carboxylase  56.96 
 
 
505 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  44.51 
 
 
534 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  43.79 
 
 
536 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  42.66 
 
 
530 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  43.43 
 
 
549 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  43.56 
 
 
530 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  42.51 
 
 
515 aa  375  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  42.57 
 
 
524 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  42.36 
 
 
527 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  43.56 
 
 
536 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  42.64 
 
 
529 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  40.51 
 
 
527 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  42.51 
 
 
515 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  40.64 
 
 
518 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  40.76 
 
 
516 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.94 
 
 
537 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.63 
 
 
546 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  41.16 
 
 
512 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  42.29 
 
 
531 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  40.88 
 
 
513 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  44.7 
 
 
513 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  41.78 
 
 
527 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  40.53 
 
 
515 aa  365  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  42.57 
 
 
541 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.51 
 
 
529 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  39.8 
 
 
514 aa  365  1e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  39.92 
 
 
518 aa  365  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  40.23 
 
 
527 aa  364  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  42.02 
 
 
543 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  44.24 
 
 
538 aa  363  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  40.15 
 
 
540 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  41.04 
 
 
508 aa  362  7.0000000000000005e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  42.65 
 
 
518 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  40.48 
 
 
527 aa  362  8e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  40.04 
 
 
512 aa  362  8e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  41.44 
 
 
523 aa  361  1e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1099  propionyl-CoA carboxylase  41.98 
 
 
535 aa  362  1e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  43.53 
 
 
517 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  42.54 
 
 
550 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  41.4 
 
 
542 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  41.73 
 
 
542 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  40.78 
 
 
516 aa  360  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  39.03 
 
 
508 aa  360  5e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  43.45 
 
 
514 aa  359  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  40.32 
 
 
517 aa  358  9e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  40.36 
 
 
516 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  39.17 
 
 
514 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  40.61 
 
 
552 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  42.46 
 
 
559 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  42.11 
 
 
510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  39.88 
 
 
531 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  41.62 
 
 
538 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  42.38 
 
 
516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  41.04 
 
 
526 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  42.11 
 
 
510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  40.71 
 
 
516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4157  carboxyl transferase  46.39 
 
 
475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  42.11 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  42.23 
 
 
521 aa  357  2.9999999999999997e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  40.16 
 
 
516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  42 
 
 
510 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  41.8 
 
 
510 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  41.13 
 
 
529 aa  356  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1342  carboxyl transferase  41.2 
 
 
511 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525317  normal  0.223983 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  41.6 
 
 
510 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  41.9 
 
 
534 aa  355  7.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  40.33 
 
 
516 aa  355  8.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  41.2 
 
 
513 aa  355  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  45.3 
 
 
514 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  41.2 
 
 
510 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  41.08 
 
 
542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  41.4 
 
 
510 aa  353  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  42.68 
 
 
510 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  41.27 
 
 
510 aa  353  5e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  40.62 
 
 
524 aa  353  5e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  41.77 
 
 
548 aa  353  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  40.37 
 
 
517 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>