More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1261 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1261  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 489 aa  966    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3485  propionyl-CoA carboxylase  86.35 
 
 		 469 aa  758    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6813  Propionyl-CoA carboxylase  63.07 
 
 		 486 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1986  propionyl-CoA carboxylase  65.94 
 
 		 476 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.176304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2037  carboxyl transferase  62.69 
 
 		 493 aa  531  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00850796  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11990  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  63.24 
 
 		 495 aa  530  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.401761  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3382  propionyl-CoA carboxylase  60.62 
 
 		 474 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3624  propionyl-CoA carboxylase  62.15 
 
 		 474 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3514  carboxyl transferase  65.29 
 
 		 470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3339  propionyl-CoA carboxylase  61.76 
 
 		 486 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7058  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  63.83 
 
 		 473 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2373  carboxyl transferase  64.02 
 
 		 474 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463514  normal  0.0764013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12276  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 6 accD6  58.49 
 
 		 473 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000992935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3758  propionyl-CoA carboxylase  57.02 
 
 		 477 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4812  carboxyl transferase  58.15 
 
 		 475 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3368  propionyl-CoA carboxylase  58.84 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0874  propionyl-CoA carboxylase  64.78 
 
 		 474 aa  501  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3430  propionyl-CoA carboxylase  58.84 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3379  propionyl-CoA carboxylase  58.84 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2775  propionyl-CoA carboxylase  58.37 
 
 		 478 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337324  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3124  carboxyl transferase  58.77 
 
 		 483 aa  498  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.714277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1637  carboxyl transferase  61.09 
 
 		 481 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0127226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3085  propionyl-CoA carboxylase  57.44 
 
 		 505 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2764  propionyl-CoA carboxylase  58.67 
 
 		 479 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  46.51 
 
 		 549 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  46.7 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  46.04 
 
 		 548 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  46.22 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  46.76 
 
 		 530 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  46.24 
 
 		 534 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  45.83 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  45.83 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  47.11 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  45.83 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.9 
 
 		 537 aa  378  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  45.21 
 
 		 536 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  46.55 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  45.83 
 
 		 542 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  44.81 
 
 		 536 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  43.3 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  46.41 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  42.86 
 
 		 551 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  42.28 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  45.92 
 
 		 541 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  45.49 
 
 		 538 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  43.85 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  44.42 
 
 		 516 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  44.52 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  40.12 
 
 		 517 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  42.67 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  39.69 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  43.97 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  45.45 
 
 		 529 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  42.95 
 
 		 514 aa  372  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  43.65 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  43.38 
 
 		 515 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  43.21 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  41.61 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  45.41 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  42.04 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  46.2 
 
 		 534 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  41.56 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  41.65 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  44.1 
 
 		 531 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  46.58 
 
 		 531 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  45.3 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  41.74 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  43.78 
 
 		 550 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  43.72 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  42.95 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  42.22 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  41.25 
 
 		 521 aa  365  1e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.92 
 
 		 532 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  44.99 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  46.27 
 
 		 529 aa  364  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  44.4 
 
 		 527 aa  363  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  41.07 
 
 		 508 aa  363  4e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  42.38 
 
 		 515 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  43.18 
 
 		 522 aa  363  5.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  43.78 
 
 		 522 aa  362  7.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  44.74 
 
 		 527 aa  362  9e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  43.72 
 
 		 520 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  43.49 
 
 		 518 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  44.74 
 
 		 559 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  39.51 
 
 		 517 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  44.07 
 
 		 518 aa  360  3e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  44.2 
 
 		 510 aa  360  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  44.88 
 
 		 543 aa  359  7e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  42.36 
 
 		 526 aa  359  7e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  42.86 
 
 		 517 aa  358  9e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  42.7 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  45.27 
 
 		 542 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  39.11 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  43.78 
 
 		 510 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  43.14 
 
 		 521 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  43.11 
 
 		 510 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  43.81 
 
 		 510 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  43.27 
 
 		 514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  43.68 
 
 		 510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  40.76 
 
 		 516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>