More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3124 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3368  propionyl-CoA carboxylase  75.98 
 
 		 473 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12276  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 6 accD6  76.4 
 
 		 473 aa  718    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000992935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3124  carboxyl transferase  100 
 
 		 483 aa  971    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.714277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3430  propionyl-CoA carboxylase  75.98 
 
 		 473 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2775  propionyl-CoA carboxylase  76.32 
 
 		 478 aa  695    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337324  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3758  propionyl-CoA carboxylase  76.69 
 
 		 477 aa  705    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3379  propionyl-CoA carboxylase  75.98 
 
 		 473 aa  704    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2037  carboxyl transferase  69.72 
 
 		 493 aa  618  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00850796  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3514  carboxyl transferase  71.76 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4812  carboxyl transferase  65.06 
 
 		 475 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1986  propionyl-CoA carboxylase  64.44 
 
 		 476 aa  561  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3382  propionyl-CoA carboxylase  66.1 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3624  propionyl-CoA carboxylase  65.19 
 
 		 474 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2373  carboxyl transferase  64.95 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463514  normal  0.0764013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6813  Propionyl-CoA carboxylase  61.34 
 
 		 486 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7058  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  63.81 
 
 		 473 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11990  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  60.34 
 
 		 495 aa  525  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.401761  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2764  propionyl-CoA carboxylase  62.47 
 
 		 479 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1637  carboxyl transferase  61.89 
 
 		 481 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0127226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3339  propionyl-CoA carboxylase  61.25 
 
 		 486 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0874  propionyl-CoA carboxylase  63.18 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1261  propionyl-CoA carboxylase  58.99 
 
 		 489 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3485  propionyl-CoA carboxylase  58.35 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3085  propionyl-CoA carboxylase  56.86 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  44.42 
 
 		 536 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  44.6 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  45.22 
 
 		 531 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  44.66 
 
 		 536 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  43.09 
 
 		 526 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.81 
 
 		 537 aa  371  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  43.51 
 
 		 543 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  41.9 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  45.05 
 
 		 530 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  41.31 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  42.64 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  44.78 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  44.1 
 
 		 534 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  43.76 
 
 		 527 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  42.77 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.12 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  42 
 
 		 542 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  41.48 
 
 		 542 aa  364  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  43.23 
 
 		 549 aa  363  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  41.24 
 
 		 513 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  43.79 
 
 		 529 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  41.68 
 
 		 538 aa  362  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  43.01 
 
 		 524 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  42.27 
 
 		 548 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  41.94 
 
 		 513 aa  360  4e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.36 
 
 		 546 aa  360  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  41.48 
 
 		 515 aa  358  9e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  43.01 
 
 		 527 aa  358  9e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  40.24 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  43.3 
 
 		 514 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  40.08 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  41.86 
 
 		 556 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  44.03 
 
 		 541 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  41.86 
 
 		 556 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  41.86 
 
 		 556 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  40.38 
 
 		 515 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  42.92 
 
 		 527 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  41.3 
 
 		 540 aa  355  8.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  40.2 
 
 		 523 aa  355  1e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  43.23 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  43.33 
 
 		 551 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  42.42 
 
 		 518 aa  353  4e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  41.33 
 
 		 516 aa  351  1e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  41.27 
 
 		 552 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  41.33 
 
 		 516 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  41.1 
 
 		 531 aa  351  2e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  41.33 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  40.72 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  41.89 
 
 		 519 aa  350  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  41.76 
 
 		 550 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  41.54 
 
 		 508 aa  350  3e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  41.77 
 
 		 517 aa  350  4e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  40.57 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  42.77 
 
 		 534 aa  349  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  40.93 
 
 		 517 aa  349  6e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.14 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  40.45 
 
 		 513 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  42.58 
 
 		 527 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  40.75 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  40.9 
 
 		 527 aa  347  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  41.1 
 
 		 531 aa  347  3e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  39.65 
 
 		 508 aa  347  4e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  40.86 
 
 		 538 aa  346  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  38.08 
 
 		 514 aa  345  8.999999999999999e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  39.96 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  41.76 
 
 		 510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  41.58 
 
 		 510 aa  343  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  41.96 
 
 		 518 aa  343  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  40.04 
 
 		 514 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  37.88 
 
 		 509 aa  342  8e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  41.8 
 
 		 510 aa  342  9e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  41.01 
 
 		 522 aa  342  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  39.68 
 
 		 516 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  41.76 
 
 		 510 aa  341  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  42.32 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  39.8 
 
 		 516 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>