More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3339 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3339  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 486 aa  957    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2037  carboxyl transferase  66.52 
 
 		 493 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00850796  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3085  propionyl-CoA carboxylase  63.69 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3368  propionyl-CoA carboxylase  62.5 
 
 		 473 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3379  propionyl-CoA carboxylase  62.5 
 
 		 473 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3430  propionyl-CoA carboxylase  62.5 
 
 		 473 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12276  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 6 accD6  61.44 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000992935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3758  propionyl-CoA carboxylase  60.55 
 
 		 477 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2775  propionyl-CoA carboxylase  60.63 
 
 		 478 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337324  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1261  propionyl-CoA carboxylase  61.13 
 
 		 489 aa  521  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3382  propionyl-CoA carboxylase  62.69 
 
 		 474 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3124  carboxyl transferase  61.25 
 
 		 483 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.714277  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3485  propionyl-CoA carboxylase  62.39 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3624  propionyl-CoA carboxylase  62.47 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4812  carboxyl transferase  59.75 
 
 		 475 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3514  carboxyl transferase  64.82 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1986  propionyl-CoA carboxylase  61.09 
 
 		 476 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2764  propionyl-CoA carboxylase  63.66 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2373  carboxyl transferase  61.99 
 
 		 474 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463514  normal  0.0764013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11990  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  57.41 
 
 		 495 aa  477  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.401761  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1637  carboxyl transferase  60.97 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0127226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6813  Propionyl-CoA carboxylase  56.07 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0874  propionyl-CoA carboxylase  60.47 
 
 		 474 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7058  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  59.18 
 
 		 473 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  44.67 
 
 		 530 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  44.67 
 
 		 529 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  45.49 
 
 		 527 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  44.67 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  43.82 
 
 		 549 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  43.85 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  44.24 
 
 		 542 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  44.15 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  42.91 
 
 		 530 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  43.53 
 
 		 524 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.08 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  44.13 
 
 		 538 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  41.95 
 
 		 527 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  43.24 
 
 		 531 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  42.89 
 
 		 513 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  43.76 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.2 
 
 		 537 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  42.63 
 
 		 556 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  42.63 
 
 		 556 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  42.63 
 
 		 556 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  42.91 
 
 		 542 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  41.44 
 
 		 523 aa  366  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  43.5 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  42.05 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  43.61 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  43.41 
 
 		 542 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  40.94 
 
 		 527 aa  369  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  42.27 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  40.57 
 
 		 516 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  40.95 
 
 		 516 aa  364  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  42.6 
 
 		 543 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  41.4 
 
 		 514 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  41.93 
 
 		 527 aa  363  4e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  42.98 
 
 		 517 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  43.74 
 
 		 510 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  40 
 
 		 516 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  43.52 
 
 		 531 aa  362  6e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  39.52 
 
 		 518 aa  362  6e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  40.74 
 
 		 516 aa  362  8e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  42.05 
 
 		 531 aa  362  8e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  40.15 
 
 		 515 aa  362  9e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  40.21 
 
 		 524 aa  362  1e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.5 
 
 		 532 aa  362  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  42.16 
 
 		 526 aa  361  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  40.17 
 
 		 516 aa  361  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  42.13 
 
 		 541 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  42.65 
 
 		 516 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  42.3 
 
 		 510 aa  360  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  40.94 
 
 		 540 aa  360  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  41.45 
 
 		 529 aa  359  8e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  42.73 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  41.07 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  42.45 
 
 		 514 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  42.8 
 
 		 518 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  42.83 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  40.79 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  40.59 
 
 		 517 aa  357  2.9999999999999997e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  43.45 
 
 		 510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  40.12 
 
 		 516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  40.49 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  43.12 
 
 		 520 aa  356  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  43.62 
 
 		 514 aa  356  5e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  41.04 
 
 		 511 aa  356  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  41.15 
 
 		 520 aa  356  5.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  39.6 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  42.79 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  44.1 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  41.56 
 
 		 510 aa  354  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  42.94 
 
 		 552 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  39.18 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  40.89 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  44.33 
 
 		 538 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  42.22 
 
 		 559 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  41.52 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  39.67 
 
 		 514 aa  353  5e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  41.4 
 
 		 522 aa  352  7e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>