More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3382 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3382  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 474 aa  936    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4812  carboxyl transferase  71.82 
 
 		 475 aa  658    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3624  propionyl-CoA carboxylase  95.15 
 
 		 474 aa  847    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203503  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3514  carboxyl transferase  74.26 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2037  carboxyl transferase  70.13 
 
 		 493 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00850796  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3368  propionyl-CoA carboxylase  66.53 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3430  propionyl-CoA carboxylase  66.53 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3379  propionyl-CoA carboxylase  66.53 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7058  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  70.07 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12276  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 6 accD6  64.84 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000992935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3758  propionyl-CoA carboxylase  63.47 
 
 		 477 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2775  propionyl-CoA carboxylase  63.54 
 
 		 478 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337324  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3124  carboxyl transferase  66.1 
 
 		 483 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.714277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2373  carboxyl transferase  69.08 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463514  normal  0.0764013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6813  Propionyl-CoA carboxylase  66.88 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1986  propionyl-CoA carboxylase  66.31 
 
 		 476 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.176304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1637  carboxyl transferase  67.08 
 
 		 481 aa  545  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0127226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11990  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  63.31 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.401761  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1261  propionyl-CoA carboxylase  60.41 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3485  propionyl-CoA carboxylase  62.39 
 
 		 469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0874  propionyl-CoA carboxylase  66.74 
 
 		 474 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2764  propionyl-CoA carboxylase  64.39 
 
 		 479 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3339  propionyl-CoA carboxylase  62.69 
 
 		 486 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3085  propionyl-CoA carboxylase  61.16 
 
 		 505 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  46.99 
 
 		 536 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  46.53 
 
 		 527 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  45.9 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  45.64 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  46.1 
 
 		 536 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  43.87 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  44.54 
 
 		 531 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  41.88 
 
 		 517 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  45.21 
 
 		 551 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  46.68 
 
 		 537 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  46.52 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  45.76 
 
 		 527 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  46.81 
 
 		 534 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  43.24 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  45.09 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  44.78 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  44.32 
 
 		 527 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  45.11 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  44.44 
 
 		 526 aa  363  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.52 
 
 		 546 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  43.5 
 
 		 550 aa  362  6e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  42.86 
 
 		 542 aa  362  8e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  44.62 
 
 		 518 aa  362  9e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  45.78 
 
 		 529 aa  361  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  44.44 
 
 		 527 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.81 
 
 		 532 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  40.84 
 
 		 515 aa  361  2e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  39.96 
 
 		 513 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  41.54 
 
 		 515 aa  360  4e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  45.05 
 
 		 541 aa  360  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  44.3 
 
 		 543 aa  359  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  41.15 
 
 		 516 aa  359  6e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  40.96 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  43.42 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  42.45 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  43.27 
 
 		 522 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  40.38 
 
 		 512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  43.75 
 
 		 514 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  41.75 
 
 		 515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  42.15 
 
 		 512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  42 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  41.36 
 
 		 540 aa  356  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  42.45 
 
 		 542 aa  355  8.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  42.54 
 
 		 527 aa  354  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  40.25 
 
 		 523 aa  353  5e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.88 
 
 		 529 aa  353  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  41.93 
 
 		 522 aa  353  5.9999999999999994e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  40.54 
 
 		 508 aa  352  8.999999999999999e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  40.55 
 
 		 514 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  42.19 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  41.26 
 
 		 518 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  45.11 
 
 		 529 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  43.82 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  40.34 
 
 		 514 aa  349  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  43.5 
 
 		 513 aa  349  8e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  41.26 
 
 		 516 aa  348  9e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  42.44 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  42.54 
 
 		 513 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  40.74 
 
 		 518 aa  347  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  42.47 
 
 		 538 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  43.18 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4157  carboxyl transferase  45.51 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  42.73 
 
 		 531 aa  346  5e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  42.45 
 
 		 542 aa  346  6e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  43.3 
 
 		 514 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  42.54 
 
 		 538 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  41.61 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  42.39 
 
 		 510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  41.28 
 
 		 548 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  39.91 
 
 		 516 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  41.35 
 
 		 522 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  39.63 
 
 		 516 aa  343  5e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  44.04 
 
 		 514 aa  342  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  42.06 
 
 		 519 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1632  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase component  40.54 
 
 		 540 aa  342  8e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  39.42 
 
 		 516 aa  342  8e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>