236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3448 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3448  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0265  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.306188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2953  NUDIX hydrolase  45.88 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0279  NUDIX hydrolase  44.04 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.113972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3159  mutT/nudix family protein  45.96 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2461  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  35.12 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  29.19 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  27.81 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  30.06 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.43 
 
 		 347 aa  72  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0855  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.36 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  35 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10636  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07260)  34.15 
 
 		 448 aa  68.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  30.65 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.09 
 
 		 427 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  33.12 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  26.71 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  31.03 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02040  expressed protein  34.35 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.239052  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  32.78 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  28.34 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  31.43 
 
 		 267 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  29.03 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  28.34 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  32.3 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>