More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3388 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3388  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 296 aa  574  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1896  hypothetical protein  27.06 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000620774  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  25.19 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  26.98 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  28.87 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  31.38 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  32.86 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  30.28 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  27.03 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  28.26 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  26.73 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  27 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  31.45 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1965  protein of unknown function DUF140  26.06 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  30.12 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  28.14 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  29.95 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  34.88 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  29.88 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  25.38 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0033  hypothetical protein  29.27 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000645659  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  27.64 
 
 		 381 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  27.64 
 
 		 382 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  28.77 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  27 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  27.59 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.01 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  26.34 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  32.48 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  29.73 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  26.26 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  28.68 
 
 		 389 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  29 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  27.51 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  27.23 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  27.16 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  29.73 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  32.2 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  32.43 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  30.84 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  26.88 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  30.09 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  28.4 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  25 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  24.57 
 
 		 383 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  30.53 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  25.62 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  32.65 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.87 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  32.18 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  23.53 
 
 		 370 aa  53.1  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  26.25 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  29.27 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  30.6 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  29.46 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  28.08 
 
 		 378 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  28.34 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  30.65 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03210  toluene tolerance protein  27.85 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  31.39 
 
 		 382 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  29.25 
 
 		 269 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  30.07 
 
 		 265 aa  52.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  27.5 
 
 		 394 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  32.14 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  28.21 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  27.27 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  24.59 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  30.66 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  32.06 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  36.17 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  28.98 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  24.38 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  26.06 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3570  protein of unknown function DUF140  35.11 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392913  hitchhiker  0.0000192838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  28.48 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  29.41 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  30.53 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  24.38 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1817  toluene tolerance protein  26.86 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  30.43 
 
 		 376 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1749  hypothetical protein  26.86 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.627131  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  29.37 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  29.71 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  27.39 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  24.03 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  24.87 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  28.36 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  29.09 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  29.91 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  29.24 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2398  hypothetical protein  31.53 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  24.66 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  26.83 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  26.38 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>