More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2284 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  100 
 
 		 190 aa  360  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.94 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5602  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  43.41 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5591  resolvase domain-containing protein  48.57 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3261  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.33 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.47 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.66 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  34.92 
 
 		 201 aa  110  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  39.36 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  36.22 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.02 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.07 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  40.78 
 
 		 209 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  34.24 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  35.68 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.46 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  43.41 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  34.97 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.22 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  39.15 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.16 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.96 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  39.15 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  34.62 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  34.78 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  36.36 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  30.05 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  34.41 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.7 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  36.87 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.43 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  39.15 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  38.5 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  32.8 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  34.97 
 
 		 185 aa  101  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  34.97 
 
 		 185 aa  101  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  37.64 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  37.64 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  34.25 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  34.41 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  30.98 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  30.6 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  30.6 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  31.69 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.7 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.14 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  30.69 
 
 		 202 aa  97.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  35.45 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  34.92 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  36.9 
 
 		 309 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.32 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  34.92 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  34.22 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4555  resolvase domain-containing protein  49.17 
 
 		 129 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191563  normal  0.331166 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  34.24 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  33.7 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  32.4 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  37.06 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  31.35 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  37.33 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  35.86 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  35.86 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  35.86 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.31 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.31 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.31 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  31.35 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  31.18 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  31.35 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  34.24 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  32.61 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  32.61 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  34.57 
 
 		 189 aa  94.4  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  35.33 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  35.14 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  37.5 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  35.68 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>