More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5591 on replicon NC_009340
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009340  Mflv_5591  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
180 aa  347  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3261  resolvase domain-containing protein  87.64 
 
 
194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154119  normal 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5602  resolvase domain-containing protein  79.55 
 
 
213 aa  238  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  48.57 
 
 
190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  43.18 
 
 
195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4555  resolvase domain-containing protein  60.95 
 
 
129 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191563  normal  0.331166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.43 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2148  resolvase domain-containing protein  57.14 
 
 
131 aa  114  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00363321  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.53 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.43 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.86 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  38.86 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.71 
 
 
188 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  38.29 
 
 
185 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  38.29 
 
 
185 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.91 
 
 
192 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  38.29 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  38.55 
 
 
184 aa  111  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.71 
 
 
187 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.71 
 
 
190 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.34 
 
 
218 aa  111  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  44.07 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  37.99 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  44.07 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.11 
 
 
184 aa  107  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  41.24 
 
 
204 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  37.14 
 
 
188 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  39.88 
 
 
184 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  37.99 
 
 
197 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 
205 aa  104  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.31 
 
 
188 aa  104  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.88 
 
 
197 aa  104  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  40.68 
 
 
204 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  40.68 
 
 
204 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  40.68 
 
 
204 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  39.31 
 
 
184 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
196 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 
197 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 
197 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  37.71 
 
 
193 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  40.11 
 
 
231 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  43.02 
 
 
199 aa  101  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  43.02 
 
 
199 aa  101  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  43.02 
 
 
199 aa  101  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.55 
 
 
182 aa  101  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.1 
 
 
201 aa  101  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  37.91 
 
 
198 aa  101  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  38.76 
 
 
193 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.33 
 
 
219 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  37.99 
 
 
196 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  40.38 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  40.61 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  40.61 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
194 aa  99  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.29 
 
 
191 aa  98.6  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  37.64 
 
 
193 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  40.68 
 
 
215 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  39.66 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  38.37 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  39.23 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  37.27 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  33.89 
 
 
188 aa  94.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  36.78 
 
 
188 aa  94.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  38.46 
 
 
228 aa  94.4  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 
180 aa  94.4  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  36.72 
 
 
192 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  36.72 
 
 
192 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  33.15 
 
 
198 aa  94.4  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.22 
 
 
201 aa  94  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  36.65 
 
 
205 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  35.84 
 
 
194 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  35.84 
 
 
194 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  37.08 
 
 
193 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  37.79 
 
 
191 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  36 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  37.79 
 
 
191 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  37.99 
 
 
201 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  36.52 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  39.87 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  34.3 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  35.39 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  36.52 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  35.39 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  35.39 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  37.27 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  37.71 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  35.39 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  35.39 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  35.39 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  35.39 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  37.29 
 
 
198 aa  92  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  37.64 
 
 
185 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.14 
 
 
193 aa  92  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  37.64 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>