More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4555 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4555  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
129 aa  243  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191563  normal  0.331166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2148  resolvase domain-containing protein  81.75 
 
 
131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00363321  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5602  resolvase domain-containing protein  59.17 
 
 
213 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143673  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5591  resolvase domain-containing protein  60.95 
 
 
180 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3261  resolvase domain-containing protein  58.33 
 
 
194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154119  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  49.17 
 
 
190 aa  97.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.5 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  43.48 
 
 
228 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0273  resolvase/recombinase  41.28 
 
 
213 aa  80.9  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  38.05 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  45.19 
 
 
197 aa  77.4  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  38.94 
 
 
196 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  37.7 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.9 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  42.72 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  44.23 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  38.98 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  44.23 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  44.23 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  44.54 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  34.75 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.4 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  35.9 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.4 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  33.9 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  38.79 
 
 
185 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.4 
 
 
185 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  37.07 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  33.33 
 
 
192 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  35.04 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  40 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  37.93 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  37.72 
 
 
185 aa  72  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  36.97 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  35.34 
 
 
188 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  42.98 
 
 
204 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  42.98 
 
 
204 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  41.24 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  41.24 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.33 
 
 
184 aa  72  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  41.24 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  41.24 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  35.04 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  35.04 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  38.58 
 
 
204 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  38.58 
 
 
204 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  38.58 
 
 
204 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.83 
 
 
219 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  34.48 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  33.05 
 
 
201 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  36.67 
 
 
203 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 
193 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.82 
 
 
191 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.9 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.9 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  37.9 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  34.48 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.9 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  38.14 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  38.14 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.72 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  39.67 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  38.79 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  37.07 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.21 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  34.68 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  35.34 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  35.04 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  35.04 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  39.34 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  38.4 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2637  resolvase domain-containing protein  36.75 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  39.2 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  38.79 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  39.2 
 
 
210 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 
198 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 
191 aa  67  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  39.66 
 
 
191 aa  67  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  36.28 
 
 
181 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  35.59 
 
 
196 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.34 
 
 
188 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.83 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  35.34 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  33.59 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  41.35 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  36.13 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  36.29 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>